基于CiteSpace软件可视化分析儿童肺炎支原体感染现状及热点研究

2020-11-17 09:44孔海波郑郭嫄周琴
中国现代医生 2020年26期
关键词:肺炎支原体可视化分析儿童

孔海波 郑郭嫄 周琴

[摘要] 目的 探究兒童肺炎支原体感染领域近10年研究现状及研究热点。 方法 以Web of Science核心合集为数据来源进行文献检索,所得文献通过CiteSpace软件依次进行国家、机构、作者合作网络分析,关键词共现、聚类、时间区域、突显词分析以及文献共被引共现、聚类、突显共被引文献分析。 结果 ①研究领域中共检索出819篇文献且每年呈现增长趋势。②研究领域中发文量前三的国家为中国、美国及日本,发文量前三的机构为苏州大学、首都医科大学、浙江大学,发文量前三的作者为Ji W、Chen ZR、Yan YD。③研究领域中2010~2020年高频关键词主要为Community acquired pneumonia、Diagnosis、Epidemiology、PCR、Respiratory tract infection等,近3年突显关键词主要为Methylprednisolone pulse therapy、Severity、Mycoplasma pneumoniae pneumonia、Resistance、Prevalence等。④研究领域中2010~2020年高频共被引文献为Jain S(2015)、Atkinson TP(2008)、Spuesens EB(2013)、Okada T(2012)、Bradley JS(2011)等,近3年突显共被引文献为Jain S(2015)、Waites KB(2017)、Sauteur PMM(2016)、You SY(2014)、Wang M(2014)等。 结论 儿童肺炎支原体感染领域近10年研究主要集中于社区获得性肺炎、诊断、流行病学、哮喘、大环内酯耐药等主题,目前研究热点主要集中于重症肺炎支原体肺炎、甲强龙冲击治疗、抗生素耐药、流行病学等主题。

[关键词] 儿童;肺炎支原体;CiteSpace;可视化分析

[中图分类号] R725.6          [文献标识码] B          [文章编号] 1673-9701(2020)26-0083-06

[Abstract] Objective To explore the research status and research hotspots in the field of children's Mycoplasma pneumoniae infection in the past 10 years. Methods The core collection of Web of Science was used as the data source for document retrieval. The obtained documents were analyzed by country, institution, and author's cooperation network, keyword co-occurrence, clustering, time zone, prominent word analysis, and document co-citation, co-occurrence, clustering, highlighting co-cited literature analysis through CiteSpace software. Results ①A total of 819 documents were retrieved in the research field, showing an increasing trend every year. ②The top three countries for postings in the research field were China, the United States and Japan; The top three institutions were Soochow University, Capital Medical University, and Zhejiang University; The top three authors were Ji W, Chen ZR, and Yan YD. ③In the research field, the high-frequency keywords from 2010 to 2020 were mainly Community acquired pneumonia, Diagnosis, Epidemiology, PCR, Respiratory tract infection, etc.; The highlighted keywords in the past 3 years were mainly Methylprednisolone pulse therapy, Severity, Mycoplasma pneumoniae pneumonia, Resistance, Prevalence etc. ④The most frequently cited documents in the research field from 2010 to 2020 were Jain S(2015), Atkinson TP(2008), Spuesens EBM(2013), Okada T(2012), Bradley JS(2011), etc.; In the past 3 years the highlighted co-cited documents were Jain S(2015), Waites KB(2017), Sauteur PMM(2016), You SY(2014), Wang M(2014), etc. Conclusion The research in the field of childhood Mycoplasma pneumoniae infection in the past 10 years has mainly focused on the topics of community-acquired pneumonia, diagnosis, epidemiology, asthma, and macrolide resistance. The current research hotspots mainly focus on the topics of severe Mycoplasma pneumoniae pneumonia, methylprednisolone shock therapy, antibiotic resistance, and epidemiology.

[Key words] Children; Mycoplasma pneumoniae; CiteSpace; Visual analysis

肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)是儿童呼吸道感染的常见病原体,容易在幼托机构、学校、夏令营等封闭场所中暴发流行,肺炎支原体呼吸道感染中有10%~40%可发展至肺炎[1]。MP肺炎约占住院儿童社区获得性肺炎(Community acquired pneumonia,CAP)的1/3,不仅可以引起肺内并发症,而且可以引起其他多系统损害,如皮肤、黏膜、心血管、血液、神经和消化系统等[2]。近年来,由于MP耐药菌株出现、免疫应答过强及混合感染等因素,MP肺炎易发展至难治性MP肺炎。而难治性MP肺炎病情进展快,病程迁延不愈,容易合并肺内外并发症,临床治疗颇为困难[3]。因此,儿童MP感染是目前儿科临床医师广泛关注的临床问题。识别该领域现阶段的主要研究方向、分析潜在的研究热点问题、分析当前有关儿童MP感染的研究成果具有重要意义。本研究基于CiteSpace软件对近10年儿童MP感染研究领域的发展趋势进行可视化分析,探索该领域研究现状与研究热点问题。

1 资料与方法

1.1 文献检索

以Web of Science数据库的Web of Science核心合集(索引:SCI-EXPANDED,SSCI,A&HCI,CPCI-S,CPCI-SSH,BKCI-S,BKCI-SSH,ESCI,CCR-EXPANDED,IC)为数据来源进行文献检索。文献检索式:TS=(adolescen or youth or teen or child or minors or infant or newborn or neonate) and TS=("Mycoplasma pneumoniae" or "M. pneumoniae");语种:English;文献类型:Article;检索时间:2010~2020年;检索截止时间:2020年3月11日;最终检索得到819篇文献,并以“其他文件格式”导出,导出记录内容为“全记录与引用的参考文献”,导出文件格式为“纯文本”。

1.2 数据处理

建立命名为“input”“output”“data”“project”的文件夹,下载的文本数据命名为“download_XX”,并放入“input”文件夹,通过CiteSpace 5.0.R1版本软件进行WOS数据转换,输出文件夹为“output”,输出完成后复制输出文件至“data”文件夹中。软件中新建新项目,Data Directory为“data”文件夹,Project Home为“project”文件夹,Data Source为“WOS”,其余设置为系统默认。

1.3 软件参数设置

在CiteSpace软件中,常规参数设置为Time Slicing为时间跨度2010~2020,时间切片为1年;Term Source为Title、Abstract、Author Keywords(DE)、Keywords Plus(ID);Links参数为Strength:Cosine,Scope:Within Slices。

1.4 国家、机构、作者合作网络分析

Node Types依次选择为Country、Institution、Author,Selection Criteria选择为TOP50,Pruning选择为Pathfinder、Pruning sliced networks、Pruning the merged network,Visualization选择为Cluster View-Static、Show Merged Network,运行软件,绘制出国家合作网络、机构合作网络及作者合作网络图谱。

1.5关键词共现、聚类、时间区域、突显词分析

Node Types选择为Keyword,Selection Criteria选择为TOP50,Pruning选择为Pathfinder、Pruning sliced networks、Pruning the merged network,Visualization选择为Cluster View-Static、Show Merged Network,运行软件,绘制关键词共现、聚类(Cluster View)、聚类时间区域(Timeline Zone)及突显词(Burstness)网络图谱。

1.6 文献共被引共现、聚类、突显共被引文献分析

Node Types选择为Cited Reference,Selection Criteria选择为TOP50,Pruning选择为Pathfinder、Pruning sliced networks、Pruning the merged network,Visualization选择为Cluster View-Static、Show Merged Network,运行软件,绘制文献共被引共现、聚类(Cluster View)、突显共被引文献(Burstness)网络图谱。

2 结果

2.1 发文数量时间分布

共检索到与儿童MP感染领域相关文献共819篇,各年发文数量趋势见图1,由图可见该领域发文数量从2010年42篇增至2019年117篇,并呈现稳步增长趋势。2020年统计时间截止至2020年3月11日。

2.2 国家、机构、作者合作网络分析

2.2.1 國家、机构合作网络分析  通过CiteSpace软件分析得到该领域国家及机构合作网络图谱(图2)。从国家合作网络中可以发现PEOPLES R CHINA(中国)、USA(美国)、JAPAN(日本)、SOUTH KOREA(韩国)、FRANCE(法国)等多个国家形成最大且广泛的合作网络,其中发文量以PEOPLES R CHINA(中国)为首。另ISRAEL(以色列,中介中心性0.58)、BELGIUM(比利时,中介中心性0.45)、CANADA(加拿大,中介中心性0.42)、FRANCE(法国,中介中心性0.38)、USA(美国,中介中心性0.32)、DENMARK(丹麦,中介中心性0.32)、SWITZERLAND(瑞士,中介中心性0.31)等国家中介中心性非常高,在国家合作网络中起到重要的中介作用。从机构合作网络中可以发现Soochow Univ(苏州大学,中国)、Capital Med Univ(首都医科大学,中国)、Shanghai Jiao Tong Univ(上海交通大学,中国)、Chang Gung Univ(长庚大学,中国台湾)、Ctr Dis Control & Prevent(美国疾病预防控制中心)、Nanjing Med Univ(南京医科大学,中国)、Fudan Univ(复旦大学,中国)等多个机构形成最大合作网络,合作关系密切,其中以Soochow Univ(苏州大学,中国)发文量为首,且上述合作网络中多数机构来源于PEOPLES R CHINA(中国)。另Zhejiang Univ(浙江大学,中国)、Kawasaki Med Sch(川崎医科大学,日本)、Seoul Natl Univ(首尔大学,韩国)等机构发文量尚可,但未形成较大的合作网络。

2.2.2 作者合作网络分析  通过CiteSpace软件分析得到该研究领域发文作者(前10)的合作网络图谱(图3)。图3中每个节点代表一位作者,作者姓名大小与发文量成正比,节点之间的连线代表学者之间的合作强度,连线越粗,合作关系越紧密,线条颜色代表合作时的年代。将发文量领先的作者定义为该研究领域的核心研究人员。在合作网络中,以Ji W、Chen ZR、Yan YD、Wang YQ、Hao CL及Shao XJ合作关系紧密,形成了一个聚集度最大的研究群体。且该研究团队发文量颇丰,国家均为Peoples R China(中国),机构均为Soochow Univ(苏州大学,中国),有良好的合作基礎与优势,因此彼此合作非常密切。另Chen ZM团队、Winchell JM团队、Xu BP团队及Ouchi K团队均形成一定聚集度的研究群体。

2.3 关键词共现、聚类、时间区域、突显词网络图谱分析

本研究通过CiteSpace软件分析得到关键词共现、聚类、时间区域及突显词图谱(图4)。通过关键词共现分析得出2010~2020年儿童MP感染领域主要聚焦于Community acquired pneumonia、Diagnosis、Epidemiology、PCR、Respiratory tract infection、Asthma、Chlamydia pneumoniae、Etiology、Adult、Macrolide resistance、Virus、Strain、Infant、Streptococcus pneumoniae、Clinical feature、Management、Pathogenesis等高频关键词。其中Community acquired pneumonia、Epidemiology、Infant、Adult、Respiratory tract infection、Macrolide resistance等关键词中介中心性非常高,在共现网络中起到关键的中介作用。

从关键词聚类图谱及各聚类高频关键词分析可得出目前主要有13个聚类,聚类排序按聚类的关键词多少排序,聚类命名按关键词及LLR算法得出。其中聚类#0主要为MP与肺炎衣原体相关的研究;聚类#1主要为MP与大环内酯耐药相关的研究;聚类#2主要为与MP菌株的分子分析相关的研究;聚类#3主要为MP与脑炎相关性的研究;聚类#4主要为MP治疗相关的研究;聚类#5为MP流行病学相关的研究;聚类#6为MP呼吸道感染相关的研究;聚类#7为MP与病因学相关的研究;聚类#8为MP与诊断相关的研究;聚类#9为MP与哮喘相关的研究;聚类10为MP与CAP相关的研究;聚类#11为MP与检测技术相关的研究;聚类#12为MP与发病机制相关的研究。其中聚类#1、#5、#8、#9、#10近2年的研究较多,主要聚焦于大环内酯耐药、流行病学、诊断、哮喘、CAP等主题。

从关键词时间区域及突显词图谱分析中可得出,近5年新出现的关键词为Mycoplasma pneumoniae pneumonia、Methylprednisolone pulse therapy、Resistance、Severity,且突显词图谱分析可得出Methylprednisolone pulse therapy、Severity、Mycoplasma pneumoniae pneumonia、Resistance、Prevalence等关键词在近3年出现频次明显增多,其中Resistance突显值最高。

2.4文献共被引共现、聚类、突显共被引文献分析

本研究通过CiteSpace分析得到文献共被引及文献共被引聚类分析图谱(图5)。

从图5可以分析得出Jain S(2015)[4]、Atkinson TP(2008)[5]、Spuesens EB(2013)[6]、Okada T(2012)[7]、Bradley JS(2011)[8]等文献被引频次最高,另Diaz MH(2015)[9]、Chironna M(2011)[10]、Morozumi M(2008)[11]、Atkinson TP(2008)[5]、Atkinson TP(2014)[12]等文献中介中心性最高,其在网络中起到重要中介作用。

从图5分析得出目前被引文献可分为14个聚类。聚类排序按聚类的高频被引文献多少排序,聚类命名按关键词及LLR算法得出。其中聚类#0、#4、#7、#13主要为大环内酯耐药菌株的发现、临床特点与分子特点、流行趋势、耐药原因等相关的研究;聚类#1为MP与CAP相关的研究;聚类#2、#3、#8、#11主要为MP感染肺外表现、临床特点、诊断、发病机制等相关研究;聚类#5、#12主要为MP感染与哮喘、难治性哮喘等相关的研究;聚类#6、#9、#10主要为难治性MP肺炎的识别、临床特点、治疗相关的研究。

从文献共引分析中进行突显共被引文献探测,发现近3年Jain S(2015,突显值13.4088)[4],Waites KB(2017,突显值11.4085)[13]、Sauteur PMM(2016,突显值7.632)[14]、You SY(2014,突显值7.1835)[15]、Wang M (2014,突显值6.8689)[16]等文献引用量突增。

3 讨论

CiteSpace软件是美国德雷塞尔大学陈超美教授2004年基于Java语言开发的信息可视化软件,可通过对大量相关文献进行国家、机构、作者、关键词、共引文献等进行合作或共现可视化分析,显示某一学科或一研究领域在一定时期内的发展趋势和动向[17]。近年来随着信息技术的发展,以CiteSpace软件为主的信息可视化分析在医学领域逐渐广泛应用[18-19]。本研究通过CiteSpace软件对近10年儿童MP感染领域内的文献进行分析,旨在探寻目前该领域研究的主要方向及潜在的研究热点,并对研究结果分析如下。

研究领域的国家、机构和作者分布情况,将有助于明确该学科领域的科研力量分布,为今后学习和合作起到指导作用。本研究通过CiteSpace软件对儿童MP感染研究领域中国家、机构、作者的可视化分析,发现目前发文量主要聚集于中国、美国及日本等国家,其中发文量前三的机构中国的苏州大学、首都医科大学、浙江大学,发文量前三的作者Ji W、Chen ZR、Yan YD均隶属于中国,可见中国在该研究领域中的研究成果颇丰。但是相较于以色列、加拿大、法国、美国等国家,中国与其他国家的合作并不密切。不过中国国内多所机构和多名作者间均有较为密切的合作,具有一定研究优势。

关键词是作者对自己撰写文章的主要内容进行精炼的词或词组,如果某一关键词在其所在的研究領域中不断出现,说明该词汇是反映此研究领域热点的内容[20]。CiteSpace软件可以对关键词的频次及不同关键词之间共现的频次进行提炼,并以可视化方式直观表现出来,从而得出该领域的研究热点。本研究通过上述软件分析关键词,得出关键词共现、时间区域、聚类及突显词图谱。从关键词共现、聚类图谱可以发现,近十年儿童MP感染领域主要聚焦于CAP、诊断、流行病学、哮喘、大环内酯耐药等主题。从时间区域、突显词图谱可以发现,近3年对重症MP肺炎、甲强龙冲击治疗、抗生素耐药、近期流行病学特点的研究突增,可见这些主题是近几年的研究热点。

文献共被引是指两篇或多篇文献同时被后来的一篇或多篇文献所引用,则称这两篇或多篇文献之间构成共被引关系,而通过对文献共被引的网络研究,可以了解某一学科或研究领域的研究基础[17]。本研究通过上述软件分析被引用文献,得到文献共被引共现及聚类网络图谱,并进行突显被引文献分析,得到近3年被引用次数最多的文献。从文献共被引共现及聚类图谱可以发现,儿童MP感染领域主要分为五大聚类,主要为CAP相关的研究,儿童MP感染的发病机制、诊断、临床表现、肺外表现等相关的研究,MP与哮喘相关的研究,大环内酯耐药MP菌株相关的研究,难治性MP肺炎相关的研究。另通过突显共被引文献分析,发现Jain S(2015)[4]、Waites KB(2017)[13]、Sauteur PMM(2016)[14]、You SY(2014)[15]、Wang M(2014)[16]等文献引用量近期突增,以上文献内容均基本契合目前研究热点。

本研究仍存在一定的不足:本研究的文献均来自于Web of Science数据库,存在一定查全问题。本研究的研究主题范围涉及内容较广,预测前沿热点可能较为宽泛。本研究国家、机构、作者、关键词及共引文献分析的入选策略均选择TOP50,研究可能存在一定偏倚。

综上所述,通过CiteSpace软件分析,儿童MP感染研究领域目前研究发文主要集中于中国,且主要为国内的机构和作者进行内部合作;近10年研究主题主要集中于CAP、诊断、流行病学、哮喘、大环内酯耐药等主题,近3年研究热点主要聚焦于重症MP肺炎、甲强龙冲击治疗、抗生素耐药及流行病学特点等主题;儿童MP感染研究领域主要集中在CAP相关的研究,儿童MP感染的发病机制、诊断、临床表现、肺外表现等相关的研究,MP与哮喘相关的研究,大环内酯耐药MP菌株相关的研究及难治性MP肺炎相关的研究等五大领域。

[参考文献]

[1] 殷勇,陆权,闫晓莉,等.肺炎支原体感染的流行病学[J].中华儿科杂志,2016,2(54):91-93.

[2] 中华医学会儿科学分会呼吸学组.儿童肺炎支原体肺炎诊治专家共识(2015年版)[J].中华实用儿科临床杂志,2015,17(30):1304-1308.

[3] 许姜姜,舒林华.儿童难治性肺炎支原体肺炎临床特征分析[J].中国当代儿科杂志,2018,1(20):37-42.

[4] Jain S,Williams DJ,Arnold SR,et al.Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S. children[J].N Engl J Med,2015,372(9):835-845.

[5] Atkinson TP,Balish MF,Waites KB.Epidemiology,clinical manifestations,pathogenesis and laboratory detection of mycoplasma pneumoniae infections[J].FEMS Microbiol Rev,2008,32(6):956-973.

[6] Spuesens EB,Fraaij PL,Visser EG,et al.Carriage of Mycoplasma pneumoniae in the upper respiratory tract of symptomatic and asymptomatic children:An observational study[J].PLoS Med,2013,10(5):e1001 444.

[7] Okada T,Morozumi M,Tajima T,et al.Rapid effectiveness of minocycline or doxycycline against macrolide-resistant Mycoplasma pneumoniae infection in a 2011 outbreak among Japanese children[J].Clin Infect Dis,2012, 55(12):1642-1649.

[8] Bradley JS,Byington CL,Shah SS,et al.The management of community-acquired pneumonia in infants and children older than 3 months of age:Clinical practice guidelines by the pediatricinfectious diseases society and the infectious diseases society of america[J].Clin Infect Dis,2011,53(7):e25-76.

[9] Diaz MH,Benitez AJ,Winchell JM.Investigations of Mycoplasma pneumoniae infections in the United States:Trends in molecular typing and macrolide resistance from 2006 to 2013[J].J Clin Microbiol,2015,53(1):124-130.

[10] Chironna M,Sallustio A,Esposito S,et al.Emergence of macrolide-resistant strains during an outbreak of Mycoplasma pneumoniae infections in children[J].J Antimicrob Chemother,2011,66(4):734-737.

[11] Morozumi M,Iwata S,Hasegawa K,et al.Increased macrolide resistance of Mycoplasma pneumoniae in pediatric patients with community-acquired pneumonia[J].Antimicrob Agents Chemother,2008,52(1):348-350.

[12] Atkinson TP,Waites KB.Mycoplasma pneumoniae Infections in Childhood[J].Pediatr Infect Dis J,2014,33(1):92-94.

[13] Waites KB,Xiao L,Liu Y,et al.Mycoplasma pneumoniae from the Respiratory Tract and Beyond[J].Clin Microbiol Rev,2017,30(3):747-809.

[14] Sauteur PMM,Unger WW,Nadal D,et al.Infection with and Carriage of Mycoplasma pneumoniae in Children[J].Front Microbiol,2016,7:329.

[15] You SY,Jwa HJ,Yang EA,et al.Effects of methylprednisolone pulse therapy on refractory mycoplasma pneumoniae pneumonia in children[J].Allergy Asthma Immunol Res,2014,6(1):22-26.

[16] Wang M,Wang Y,Yan Y,et al.Clinical and laboratory profiles of refractory Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children[J].Int J Infect Dis,2014,29:18-23.

[17] 陈悦,陈超美,刘则渊,等.CiteSpace知识图谱的方法论功能[J].科学学研究,2015,33(2):242-253.

[18] 石晶晶,石树青,杜柏,等.基于CiteSpace的可视化分析在医学领域的应用[J].中国循证心血管医学杂志,2020, 12(1):10-13.

[19] 陈莹,郭怡博,郭然,等.基于文献计量学的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)研究可视化分析[J].中国中药杂志,2020,45(10):2239-2248.

[20] 石习敏,陈娟,杨均雪,等.基于知识图谱的國内外医学数据挖掘研究可视化探析[J].中国全科医学,2017,20(21):2623-2628.

(收稿日期:2020-07-29)

猜你喜欢
肺炎支原体可视化分析儿童
我国职业教育师资研究热点可视化分析
声波吹灰技术在SCR中的应用研究
可视化分析技术在网络舆情研究中的应用
国内外政府信息公开研究的脉络、流派与趋势
小儿支气管哮喘与小儿肺炎支原体感染相关性分析
留守儿童
经支气管镜注射布地奈德治疗儿童肺炎支原体大叶性肺炎
六一儿童
儿童肺炎支原体感染299例临床分析
小儿肺炎支原体感染的临床检验分析