NCAM L1小基因模型的建立及其剪接模式研究

2011-01-23 11:24:28彭正羽
浙江大学学报(医学版) 2011年4期
关键词:模型研究

张 薇,沈 权,彭正羽

NCAM L1小基因模型的建立及其剪接模式研究

张 薇1,沈 权1,彭正羽2

(1.浙江大学城市学院医学与生命科学学院,浙江杭州310015;2.复旦大学生物医学研究院,上海200032)

目的:建立可用于前体mRNA可变剪接分析的NCAM L1小基因模型。方法:以人基因组DNA为模板,通过PCR扩增获得NCAM L1小基因片段,并将其克隆至真核表达载体中,构建小基因的质粒。在此基础上,用NCAM L1小基因模型转染HeLa、COS-1、PFSK及R28细胞,并用RT-PCR进行被剪接的小基因产物的半定量检测。结果:NCAM L1小基因在4种细胞中的剪接模式不同,在PFSK以及Hela细胞中,存在2种剪接亚型,而在COS-1以及R28细胞中只有一种剪接亚型存在。结论:所构建的NCAM L1小基因可用于细胞水平的基因剪接分析。

Hela细胞;质粒;遗传载体;剪接体;NCAM L1;小基因;前体mRNA;可变剪接

[JZhejiang Univ(Medical Sci),2011,40(4):427-431.]

前体mRNA的剪接是基因表达调控中的重要环节,目前已知两种互相关联的剪接方式:组成性剪接和可变剪接[1]。在组成性剪接中,剪接位点不因细胞种类发育阶段或环境而改变,因而最终形成的基因及其表达产物也是不变的。而可变剪接则不然,通过可变剪接过程可以将前体mRNA的外显子选择性地组合、连接在一起,并最终表达出功能各异的、甚至完全相反的蛋白质亚型[2]。前体mRNA的剪接是在“剪接复合体”中进行的,剪接复合体包含snRNPs(small nuclear ribonucleoproteins)、hnRNPs(hetero-geneous nuclear ribonucleoproteins)和 SR(serine/arginine-rich)蛋白及其相关蛋白[3-4]。调控可变剪接的因素包括顺式元件和反式调节因子[5-6]。

在前体mRNA可变剪接的研究中,小基因模型是一种新发展起来的有效的研究手段[7-8]。所谓小基因是基因中的一个片段,可用于基因的功能以及表达调控机制研究,因其片段短而得名。……

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