2009～2010年上海地区急性呼吸道感染病毒病原谱分析

何静，龚燕，张万菊，徐磊，刘祎，钱方兴，揭志军，俞慧菊，李杨，周志统，胡芸文

1. 上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心病原体检测与生物安全部，上海 201508； 2. 复旦大学附属华山医院，上海 200040; 3. 上海市长宁区中心医院，上海 200051； 4. 上海交通大学医学院附属新华医院，上海 200092； 5. 同济大学附属东方医院，上海 200120

2009年，2009甲型H1N1流行性感冒(简称流感)在全世界暴发[1]。2010年8月，世界卫生组织(World Health Organization，WHO)宣布2009甲型H1N1流感进入大流行后阶段[2]。为调查在该特定背景下引起上海地区急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection，ARTI)的病毒病原谱特征，本研究于2009年5月～2010年12月，采集2 044例ARTI患者的2 044份标本，进行9种呼吸道病毒的核酸检测，分析上海地区引起ARTI的病毒病原谱，并探讨2009甲型H1N1流感大流行对其构成的影响, 为动态了解上海地区病毒性ARTI的流行特征和规律提供重要依据。

1 材料和方法

1.1 标本采集

收集2009年5月～2010年12月于复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属新华医院、上海市长宁区中心医院和同济大学附属东方医院因ARTI就诊的门诊或住院患者2 044例(男1 089例、女955例)，其中急性上呼吸道感染(upper respiratory tract infection，URTI)包括上呼吸道感染、扁桃体炎共1 163例；急性下呼吸道感染(lower respiratory tract infection，LRTI)包括支气管炎、肺炎共881例。在患者发病的3 d内，采集鼻咽拭子标本2 005份、肺泡灌洗液39份，放入MEM转运培养液(含1 mg/ml庆大霉素、1 000 u/ml青霉素、2.5 μg/ml两性霉素B和2%胎牛血清)中，暂存于4 ℃，在48 h内冷链运送至实验室。

1.2 核酸抽提和反转录

以罗氏公司的High Pure Viral Nucleic Acid Kit试剂盒抽提鼻咽拭子和肺泡灌洗液标本中的病毒核酸(DNA/RNA)，抽提物用50 μl洗脱液溶解，立即置-70 ℃冰箱保存备用。……