分子标记技术在棉花育种中的应用

赵兴华，渠云芳，黄晋玲

（山西农业大学农学院，山西太谷030801）

与其他农作物相比，棉花的基因组学及利用分子标记技术进行棉花育种改良等方面的研究比较落后。近30 a来，随着分子生物学和生物信息学的迅速发展，使得建立在DNA水平上的、以揭示棉花遗传的分子标记技术研究成为可能。

分子标记是以DNA分子碱基序列的变异为基础，所揭示的多态性直接反映基因组DNA间的差异。与形态学标记、细胞学标记和生化标记相比，分子标记具有准确度高、数量多、多态性高、共显性好、对表型无影响、检测手段简单快捷以及开发和使用成本低等优越性。因此，分子标记技术以其自身的优越性在棉花遗传图谱构建、分子标记辅助选择育种、重要农艺性状基因的标记定位、种质资源的遗传多样性分析和纯度鉴定等方面具有重要的应用价值[1]。

本文对棉花上应用的几种分子标记技术以及它们在棉花育种中的应用与展望进行了阐述。

1 分子标记的类型

分子标记根据其产生的特点，大致可分为4类[2]：第一类，以DNA—DNA杂交技术为基础，如限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP），数目可变串联重复序列多态性（Variable Numberof Tandem Repeat，VNTR）。第二类，以PCR技术为基础，如随机扩增片段长度多态性DNA（Random Amplified Polymorphic DNA，RAPD），简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR），序列特异性扩增片段（Sequence-Characterized Amplified Region，SCAR），相关序列扩增多态性（sequence-related amplified polymorphism，SRAP），靶位区域扩增多态性（target region amplified polymorphism，TRAP），扩增片段长度多态性（Amplified Fragment Length Polymorphism，AFLP）。第三类，以DNA单链、单核苷酸多态性为基础，如单链物质多态性（Single Strand Conformation Polymorphism，SSCP）、单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP），衍生的酶切扩增多态性（derived Cleaved Amplified Polymorphic Sequence，dCAPS）。第四类，原位……