对蚕学专业引入基因组与生物信息学课程的思考

向 恒 张瑞芝 潘国庆 周泽扬＊

（1.西南大学蚕学与系统生物学研究所；2.西南大学动物科技学院；3.西南大学生物技术中心，重庆 北碚 400715）

当今，高通量技术的应用对于生物分子定量和定性的研究来说具有重要意义，也表明生命科学正在从一种以描述性为主的学科发展到以信息为主的学科。因此，生物学家就需要提高数学、计算机和统计分析等方面的技能，而提高学生在生命科学中信息分析能力的需要也是迫切的。然而，由于计算机硬件、软件条件或者教师知识程度等多个方面的原因，基因组与生物信息学的教育水平却远落后于生物化学和分子生物学，表现出了诸如序列分析等多个方面技能上的不足。正是由于存在这些限制，基因组与生物信息学课程经常被限制在研究生阶段，而未引入本科生的学习范畴。随着当前基因组和蛋白质组数据的爆炸性增长，本科生关于基因组与生物信息学的学习需要就如过去学习色谱层析和电泳技术的需要一样，同等重要。早在2003年，西南大学家蚕研究团队就完成了家蚕基因组的框架图谱，在此基础上，2008年又公布了精细图谱，序列覆盖度高达8.48倍，精确鉴定了14.6万个以上的基因。基于这些基因组数据，开展蚕学专业学生的基因组与生物信息学教学具有明显的平台优势。

近几年，一些基于网络的易操作程序，诸如Biology Workbench（http：//workbench.sdsc.edu/）和 Protein Explorer （http：//www.umass.edu/microbio/chime/pe_beta/pe/protexpl/），已经大大降低了基因组与生物信息学的教学难度，可以运用于该门课程中。……