种间转移扩增法筛选长爪沙鼠微卫星位点

谭元卿，李 薇，杜小燕，路 静，吴艳花，王 超，陈振文

(首都医科大学基础医学院实验动物学系，北京 100069)

种间转移扩增法筛选长爪沙鼠微卫星位点

谭元卿，李 薇，杜小燕，路 静，吴艳花，王 超，陈振文

(首都医科大学基础医学院实验动物学系，北京 100069)

目的 筛选长爪沙鼠新的微卫星位点，为长爪沙鼠遗传分析提供遗传标记物。方法 从GenBank中随机选取小鼠微卫星位点引物536对，用这些引物对长爪沙鼠基因组DNA扩增，将阳性目的条带进行序列分析，找出符合微卫星序列特征的短串联重复序列。结果 536对小鼠微卫星引物在长爪沙鼠基因组中扩增出了313个阳性条带，经序列分析，确定130个长爪沙鼠微卫星位点;其中完美型位点占80.77%(105/130)，不完美型位点占19.23%(25/130)，与小鼠同源性为 24.3%(130/536)。将筛选出的微卫星位点在 GenBank中注册，注册号从GU562694到GU562823。结论 小鼠和沙鼠的微卫星位点具有较高的同源性，用小鼠的微卫星位点引物直接扩增长爪沙鼠基因组DNA可有效地筛选出长爪沙鼠微卫星位点。

小鼠;长爪沙鼠;微卫星;种间转移扩增

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 实验动物：清洁级长爪沙鼠22只，性别不限，体质量49～85 g，由首都医科大学实验动物部提供【SCXK(京)2000-0012】，用于提取基因组DNA。

1.1.2 仪器：琼脂糖凝胶电泳仪(北京六一仪器厂);3K18高速冷冻离心机(Sigma公司，USA);超净工作台(上海智城分析仪器制造有限公司);PCR仪(PTC-200 Peltier Thermal cycle，Bio-Rad公司，USA)。

1.1.3 试剂：蛋白酶 K(Merck公司产品);低熔点琼脂糖(Promega公司产品);50bp DNA step ladder marker、Taq DNA聚合酶及 dNTP(大连宝生物工程有限公司，中国);克隆测序由北京鼎国生物技术有限责任公司完成。……