鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析

2011-10-27 07:29:54李盛钰赵玉娟戴大海曾宪鹏张贵斌杨贞耐
食品科学 2011年17期
关键词:生物

李盛钰,赵玉娟,张 雪,戴大海,曾宪鹏,张贵斌,杨贞耐,*

(1. 吉林省农业科学院农产品加工研究中心,吉林 长春 130033;2. 长春新高食品有限公司,吉林 长春 130000)

鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析

李盛钰1,赵玉娟1,张 雪1,戴大海1,曾宪鹏1,张贵斌2,杨贞耐1,*

(1. 吉林省农业科学院农产品加工研究中心,吉林 长春 130033;2. 长春新高食品有限公司,吉林 长春 130000)

根据已知乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守区设计引物,扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8磷蛋白磷酸酶基因(wzb)序列,并通过染色体步移法克隆了鼠李糖乳杆菌 JAAS8 参与胞外多糖生物合成基因簇全部序列 (19.7kb),利用生物信息学方法预测了基因簇 16个阅读框的结构和功能。结果表明,该序列与已报道的乳杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性。welF、welG、welH、welI、welJ和welE为合成寡糖重复单元的糖基转移酶基因。rmlA、rmlB和rmlC基因与dTDP-L-鼠李糖前体的生物合成密切相关。wzd、wze、wzy、wzx、wzr和wzb基因预测蛋白主要参与胞外多糖合成过程中多糖链长检测、聚合和输出。

鼠李糖乳杆菌;胞外多糖;基因簇;生物合成

乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB) 是一类能发酵利用碳水化合物并产生大量乳酸的细菌。乳酸菌发酵能够产生多种风味物质和一些功能性成分。胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)是乳酸菌发酵过程的重要代谢产物,它们有的黏附于细胞表面形成荚膜多糖(capsular polysaccharides,CPS)或分泌到周围培养基中形成黏液多糖(slime polysaccharides,SPS)[1]。胞外多糖有利于改善发酵乳制品的理化特性并赋予产品独特的风味和生理功能[2-3]。

乳酸菌胞外多糖是由成百上千个相同的寡糖重复单元聚合而成的一类长链高分子化合物。……

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