倪志华
(福建生物工程职业技术学院 保健营养学系,福建 福州 350008)
药用植物人参和三七的密码子用法分析
倪志华
(福建生物工程职业技术学院 保健营养学系,福建 福州 350008)
采用高频密码子分析法,对人参属药用植物人参(PanaxginsengC. A. Mey.)和三七[PanaxNotoginseng (Burk.) F. H. Chen]的蛋白质编码基因序列(coding DNA sequence,CDS)进行了同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous coden,RFSC)分析,确定了人参高频密码子6个和三七高频密码子7个。将人参和田七的密码子使用频率进行比较,结果显示两者的密码子偏爱性具有较高的一致性。分析结果为外源基因在人参和三七中的表达提供参考。
人参;三七;高频密码子;密码子偏爱性
密码子是核酸与蛋白质联系的纽带,是生物体内遗传信息传递的基本环节。编码天然蛋白质20种氨基酸的密码子共有61种,每种氨基酸可由1~6个密码子编码,所以存在简并性。密码子的这种简并性特征造成了不同物种的密码子使用偏爱性不同,即编码同一个氨基酸的密码子在不同物种中具有不同的使用频率。这种现象会导致外源基因在宿主细胞中的表达量降低。分析表达外源基因物种的密码子用法,可为提高外源基因在该物种中的表达提供依据。
人参(Panax ginseng C. A. Mey.,简称为P.g)和三七(Panax Notoginseng (Burk.) F. H. Chen,简称为P.N)同为五加科人参属珍贵药材,古即有“南三七,北人参”之说法,千百年来一直被医家广泛运用。人参含有人参皂苷、人参多糖等多种物质,可增强机体对各种应激刺激的非特异抵抗力,具有抗衰老、免疫调节、降血糖、保肝护肝、抗肿瘤等多种医疗保健功效[1];……