杨 柳,刘铁英,李雪莲
(1.吉林工商学院 信息工程分院,长春 130062;2.长春职业技术学院 信息分院,长春 130033;3.吉林省财政厅 吉林省财税信息中心,长春 130021)
混合群智能算法在模体识别中的应用
杨 柳1,刘铁英2,李雪莲3
(1.吉林工商学院 信息工程分院,长春 130062;2.长春职业技术学院 信息分院,长春 130033;3.吉林省财政厅 吉林省财税信息中心,长春 130021)
为了避免传统吉布斯算法的诸多缺陷,提高算法的求解能力,对蚁群算法(ACO:Ant Colony Optimization)进行了改进:引入粒子群算法(PSO:Particle Swarm Optimization)动态调节ACO函数中的参数获得最优解。在奔腾PC机的实验平台上、Windows 2003Server操作系统下、开发工具为VB的模拟实验中,结果证明,混合的群智能算法使经典旅行商问题求解的计算时间缩短,提高了算法的收敛速度,有较好的发展前景。利用PSO处理连续优化问题的优点,将混合算法应用于生物信息学的模体识别中,可实现更加快速的基序发现处理。
吉布斯算法;粒子群算法;模体识别
传统的蚁群算法[1,2]在离散问题上取得了很好的研究结果,但有几个突出问题制约了算法的应用。其中重要的一点是,蚁群算法的参数繁多,设置参数时根据人工经验进行,所以对不同问题,蚁群算法的参数都需要进行改变,而且参数选择往往对算法的结果有至关重要的影响。通常,同一问题,用同样算法,由于参数设置的不同,结果大相径庭。一个完善的算法不仅要有稳定的适应性,还要有输出结果的一致性。现将具有全局优化功能的群智能算法粒子群优……