单股正链RNA病毒基因组非编码区结构与功能研究进展

哲名家，陈宗艳，李传峰，刘光清

(中国农业科学院上海兽医研究所，上海 200241)

单股正链RNA病毒是一类成员众多的病毒大家族，其成员可以感染几乎所有的动物和植物，如由冠状病毒引起的非典型性肺炎，由脊髓灰质炎病毒导致的小儿麻痹症，由丙型肝炎病毒（Hepatitis type C virus，HCV）引发的非A 非B病毒型肝炎，由口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus, FMDV）造成的动物口蹄疫，由乙型脑炎病毒引发的人和动物的流行性脑炎等。由此可见，尽快找到治疗、预防和控制RNA病毒性传染病的药物、疫苗或措施已成为国内外科学家亟需解决的问题。要消灭病毒，首先要了解病毒，包括病毒的复制、表达和包装等生命周期各个阶段的特点。在漫长的生物演化过程中，为了节约有限的基因资源、进行高效的表达和复制，单股正链RNA病毒逐渐形成了一些可以自主调控病毒基因表达和复制功能的特殊性元件，即所谓的RNA顺式作用元件（cis-acting RNA elements），包括保守的一级核苷酸序列和复杂的RNA高级结构。大量研究资料表明，单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区（non-coding region，NCR）往往存在一些重要的顺式调控元件，它们不仅参与RNA-RNA间相互作用，还可以通过与反式作用因子（transacting factor）结合，发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用。本文就近年来一些关于单股正链RNA病毒基因组非编码区的结构与功能研究进展情况进行综述。

1 5'/3'NCR含有的特征性序列/结构元件

1.1 茎环结构 单股正链RNA病毒基因组5'/3'NCR内部的核苷酸常发生回文现象，多呈发夹样茎-环结 构（stem-loop structure，SL）， 属 于RNA二级结构。……