史亚东,董海聚,王荣军,张龙现,宁长申,菅复春
隐孢子虫是一种肠道原生寄生虫,可以引起人和动物的隐孢子虫病。该病的最主要症状是腹泻,已被列为世界最常见的6种腹泻病之一[1],并被世界卫生组织(WHO)和美国疾病控制中心(CDC)列入新发传染病。隐孢子虫大小一般为5~8μm,常用的检测方法可以分为病原学检测(主要借助显微镜)、免疫学检测和分子生物学检测3类[2],分子生物学检测因其优势较多而广泛应用。Noto mi等[3]2000年建立了一种快速、简单、灵敏、特异并且低成本的核酸扩增方法——环介导等温扩增法(LA MP),这种新颖的核酸扩增方法可以在短时间内简单地得出检测结果,这种优势使其在病原分子检测领域得到广泛地应用,如应用于病毒、细菌和寄生虫等病原的检测[4-7]。
1.1 虫种 本实验室保存的微小隐孢子虫(Cr yptosporidiu m par vu m)、贾第虫(Giar dia sp)、肠阿米巴(Enta moeba sp)、球虫(Ei meria tenell a)和类圆线虫(Str ongyloides sp)5种阳性样品。
1.2 主要试剂和仪器 Bst DNA聚合酶大片段(Bst DNA pol y merase lar ge frag ment)购自 NEB公司,三甲铵乙内酯(Betaine)购自Sig ma公司,Taq DNA聚合酶、DL2000 DNA Mar ker和脱氧核苷三磷酸(d NTP Mixt ure)购自Ta Ka Ra公司,MseI内切酶购自 Fer mentas公司,SYBR Green I(10 000×)购自Solarbio公司,E.Z.N.A.®Stool DNA Kit(粪便DNA提取试剂盒)购自OMEGA公司。电热恒温水浴锅(北京市长风仪器仪表公司,型号HwS24),稳压稳流电泳仪(北京市六一仪器厂,型号DYY-5),凝胶成像仪(SYNGENE公司,型号In-Genius L HR)。
1.3 DNA的提取 按照E.Z.N.A.®Stool DNA Kit说明书操作,对保存的不同虫株阳性样品提取DNA,-20℃保存备用。
1.4 引物设计选择及合成 袁忠英等[8]在国内首次报道用LA MP检测牛源隐孢子虫卵囊,其根据微小隐孢子虫18s r RNA基因序列(Gen Bank登录号3873244)设计了4条隐孢子虫特异性引物(F3、B3、FIP、BIP)。……