拟南芥和大白菜LUG蛋白家族的生物信息学分析

2012-10-26 05:04:16马宗琪王凤德邱念伟
井冈山大学学报(自然科学版) 2012年4期
关键词:分析

马宗琪,王凤德,邱念伟

拟南芥和大白菜LUG蛋白家族的生物信息学分析

马宗琪1,王凤德2,*邱念伟1

1.师范大学生命科学学院,山东,曲阜 273165; 2.山东省农业科学院蔬菜研究所,山东,济南 250100)

LUG蛋白属于WD40超家族基因,具有7个重复的WD40结构域,参与花器官的发育。本项研究系统鉴定了7个拟南芥和5个大白菜的LUG基因,并对这些基因编码的蛋白质序列进行了序列保守性和系统进化分析。结果表明,除了AtLUG6含有5个重复的WD40结构域之外,其余所有的LUG蛋白都具有7个重复的WD40结构域。在进化上,LUG蛋白家族可分为两个不同的亚家族,并且这种特征在拟南芥和大白菜分离之前就已经形成。

拟南芥();大白菜();生物信息学分析;LUG蛋白;WD40结构

关于花器官发育的一个重要模型是ABC模型,其基本理论是将花分为萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊4轮,这4轮花器官分别由A、B、C三类基因调控,其中A类基因调控萼片的发育,A和B类基因共同作用调控花瓣的发育,B和C类基因共同决定雄蕊的发育,C类基因决定雌蕊的发育[1]。在拟南芥中,A类基因以()、()为代表,B类基因以()和()为代表,C类基因以()为代表。其中C类基因决定内两轮,即雄蕊和雌蕊的发育,只在内两轮中表达。LEUNIG (LUG)是在拟南芥中发现的调节基因表达的转录抑制因子,参与拟南芥的花发育过程[2]。在()和()突变体中,基因异位地在花的外两轮表达,导致萼片转化成心皮,花冠转化成雄蕊,说明基因的功能是在花的外两轮中抑制基因的表达[3-4]。此外,也参与调节其它与无关的发育过程, 例如突变体还表现出柱头裂开、心皮和胚珠发育不正常、雌性和雄性育性降低,花和叶子狭窄等性状[5-7]。……

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