徐 斌,石 英,惠 威,何佳丽,魏琳琳,王 征,陈德喜
(首都医科大学附属北京佑安医院 肝病内分泌科,北京100069)
获得性免疫缺陷综合征(Acquired Immunodeficiency Syndrome,AIDS)简称艾滋病,是由 HIV(Human Immunodeficiency Virus)病毒引起的一种传染性疾病。HIV病毒侵入人体后破坏机体的免疫系统,引起一系列严重疾病,病后无特效疗法,病死率高。人类第17号染色体的16个基因组由两对亲缘关系很近的基因组构成,即CCL3L—CCL3L1和CCL4—CCL4L1。CCL3和CCL3L1蛋白93个氨基酸中有88个相同,这两个蛋白均是CCR5受体的配体,在体外试验中均可抑制 HIV-1病毒复制[1]。影响HIV-1易感性的宿主因素很多,人们由早期对HLAⅠ等位基因、CCR5和CCR2基因变异的关注,转向CCR5结合细胞因子水平的不同。本研究探讨CCL3L1基因拷贝数不同对HIV-1易感性的影响,有助于监测个体对HIV-1的易感性,对监测疫苗的有效性具有重要意义。
1.1 健康人群 2005年5月至2006年10月间,北京佑安医院血库,采集97例健康献血原的抗凝全血。其中男66例,女31例,平均年龄36±18岁。
1.2 HIV/AIDS患者 2005年5月至2006年10月间,北京佑安医院门诊或住院的HIV/AIDS患者81例,男性54例,女性27例,平均年龄37±1.2岁。所有患者均为血液传播感染并未经高效抗逆转录病毒治疗,病程平均6.2±0.3年。
1.3 实验方法
1.3.1 基因组DNA提取 按QIAamp DNA Mini Kit基因组提取试剂盒说明书步骤进行。
1.3.2 实时定量PCR检测CCL3L1基因拷贝数引物选择:(1)CCL3L1引物:sense primer:5’-tctccacagcttcctaaccaaga 3’;antisense primer:5’-ctggacccactcctcactgg 3’。(2)管家基因β-globin引物:sense primer:5’-ggcaaccctaaggtgaaggc 3’;antisense:5-ggtgagccaggccatcacta 3’。
以上引物由宝生物公司合成。SYBR反应体系:5×SYBR Green 25μl,引物(25μmol/L)2.5 μl,dNTP(10mmol/L)4.0μl,Mg2+4.0μl,cDNA1.0μl,Taq酶0.25μl,H2O 5μl,10×buffer 5.0μl。反应条件:92℃2min预变性,92℃30s变性,55℃30s退火,72℃30s延伸,35个循环,72℃7min。反应结束后,由电脑自动分析并计算结果。
1.3.3 HIV/AIDS患者血浆中 HIV RNA水平的定量检测 采用bDNA法进行检测。使用德国Bayer公司的System 340bDNA分析仪,试剂采用厂家配套试剂。……