虫纹鳕鲈线粒体COI基因片段的克隆与序列分析

虫纹鳕鲈线粒体COI基因片段的克隆与序列分析

对虫纹鳕鲈(Maccullochellapeelii)线粒体DNA细胞色素氧化酶I亚基(cytochrome oxidase subunit I，COI)基因进行了扩增、克隆和测序，并对COI序列进行了分析。结果显示，澳洲虫纹鳕鲈COI基因序列长度为652bp，A、C、T、G 4种碱基平均比例分别为25.3%、16.6%、32.9%、25.2%，A+T比例 (58.2%)明显高于G+C (41.8%)。与从GenBank中查到的其他6种真鲈科鱼类的同源序列比对，并采用最大简约法(MP)构建系统进化树，结果显示：7种真鲈科鱼类聚在一起，分为2个大的支系，麦鳕鲈属鱼类聚为一支，麦氏鲈属、鳜属和花鲈属的鱼类聚为一支。其中，花鲈属的花鲈与鳜属鱼类亲缘关系较近，与其他两属关系稍远。所得的聚类结果与传统的形态分类基本一致。

虫纹鳕鲈(Maccullochellapeelii)；COI基因；克隆；序列分析

虫纹鳕鲈(Maccullochellapeelii)隶属硬骨鱼纲(Osteichthyes)鲈形目(Perciformes)真鲈科(Percichthyidae)麦鳕鲈属(Maccullochella)，原产于澳大利亚东南部墨瑞达令河流域。此鱼为世界上最大淡水鱼之一，生长速度快、环境适应力强、繁殖力强。不仅适合水产养殖，亦可做观赏鱼。目前国内虽有几家单位引进了虫纹鳕鲈，但有关研究尚少，主要集中在其生物学特性及驯化养殖等方面[1-4]，对其线粒体DNA(mtDNA)的研究尚未见报道。

COI基因是线粒体氧化呼吸链的重要成员，进化速度快，包含的遗传进化信息量大，在鱼类群体遗传结构和系统进化等领域应用较广[5-7]。本研究对引进虫纹鳕鲈mtDNA COI基因序列片段进行了扩增和测序，并对其序列特征进行了分析，结合GenBank中已报道的其他6种真鲈科鱼类COI基因的同源序列进行了比较，以期为虫纹鳕鲈的种质资源和遗传育种研究提供背景资料，并为真鲈科鱼类分类和系统进化提供分子生物学上的理论依据。……