李武县,徐 勇,2,刘雪燕,秦晓林,梁勤东,戴 勇,4,涂植光
(1.重庆医科大学教育部临床检验诊断学重点实验室,重庆400016;2.广东省深圳市坪山新区人民医院,广东 深圳518118;3.广东省深圳市人民医院急诊ICU,广东 深圳518020;4.广东省深圳市人民医院临床医学研究中心,广东 深圳518020)
唐氏综合征胎儿21号染色体上新微小RNA基因的鉴定和功能分析
李武县1,徐 勇1,2,刘雪燕3,秦晓林1,梁勤东1,戴 勇1,4,涂植光1
(1.重庆医科大学教育部临床检验诊断学重点实验室,重庆400016;2.广东省深圳市坪山新区人民医院,广东 深圳518118;3.广东省深圳市人民医院急诊ICU,广东 深圳518020;4.广东省深圳市人民医院临床医学研究中心,广东 深圳518020)
目的:利用Solexa高通量深度测序技术鉴定21号染色体上新的微小RNA (miRNA)基因,为阐明21号染色体功能、探索唐氏综合征 (DS)患者新的治疗靶点提供依据。方法:收集5例经染色体核型分析诊断为DS胎儿的脐带血和3例正常胎儿脐带血,分析染色体核型;提取胎儿脐带血单个核细胞总RNA,构建小RNA文库,采用Solexa高通量深度测序、计算机分析、Stem-loop RT-PCR法鉴定miRNA基因并分析其生物学功能。结果:血染色体核型分析,5例DS胎儿脐带血显示DS标准核型,3例正常胎儿脐带血显示正常核型;在DS胎儿脐带血中共发现21个新miRNA,其中仅1个候选miRNA来源于21号染色体,位于21号染色体的“DS关键区域”,命名为 “miR-nov21”,后者在DS胎儿脐带血单个核细胞中表达水平高于正常胎儿。生物学功能分析,miR-nov21可调节211个靶基因共215个位点,与基因的表达、细胞分化的调节、胚胎形态的发生和心脏的发育有关。……