张晓萌 马普 王洪迪 王秀利
(大连海洋大学水产与生命学院,大连 116023)
作为第三代分子标记的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是基因型和表型之间最好的研究载体,已成为最为理想的遗传标记之一。随着DNA测序技术的发展,SNP分子标记发展迅速,已广泛应用于农学、医学、生物进化等众多领域[1]。SNP分子标记的出现极大地促进了遗传学、基因组学和育种学等相关学科的发展[2]。近年来,水产动物中的SNPs研究与应用取得了阶段性成果,但与人类及高等哺乳类动物差距仍较大,与畜牧业中的同类研究水平也有较大的差距。本文重点介绍SNPs在水产动物疾病、生长性状和繁殖性能等方面的研究进展。
SNP是指由于单个核苷酸发生变异而引起的基因组水平上DNA序列的多态性,其形式包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失[3]。根据对生物遗传性状的影响,SNP可以分为蛋白编码的SNP和非蛋白编码的SNP。在蛋白编码的SNP中,如果编码序列的改变不影响所翻译的氨基酸序列则称为同义蛋白编码SNP。反之,若编码序列的改变导致翻译的氨基酸序列改变从而改变蛋白质的生物学功能或形成终止密码子使翻译终止,则称为非同义蛋白编码SNP[4]。一个SNP表示在基因组某个位点上有一个核苷酸的变化,而多个核苷酸的变化则表示为SNPs。
SNP具有位点丰富且分布广泛,富有代表性等优点。与串联重复微卫星(SSR)等多态性相比,SNP是基于单核苷酸的突变,其遗传稳定性与精确性相对较高[5]。……