杂合抗菌肽MgJ 基因真核表达载体的构建

2013-04-23 11:53
中国酿造 2013年8期
关键词:凝胶电泳琼脂糖抗菌肽

尹 佳

(吉林化工学院环境与生物工程学院,吉林 吉林 132022)

抗菌肽(antimicrobial peptides)是具有抗菌活性的一类肽的总称。通常由13~50个氨基酸组成,为阳离子型多肽[1]。两性α-螺旋结构和两性β-折叠结构是抗菌肽最显著的结构特征。抗菌肽对细菌具有很强的杀伤作用,不宜在原核系统中直接表达,一般采用融合表达或在酵母中表达[2-3]。

本研究通过对抗菌肽Magainin-Ⅱ和JaponicinⅡ两个基因(简称M和J)的一级结构和二级结构的分析,用一段编码ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性连接肽序列将M基因和J基因相连,以利于M和J基因各自的空间折叠。选用巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)偏爱的密码子,通过重叠区基因扩增法(SOE法)[4]人工合成MgJ基因,然后将其连接至在巴斯德毕赤酵母中高效表达的表达载体pPICZα A上。其设计目的是获得比MagaininⅡ和JaponicinⅡ生物活性更高的抗菌肽,为杂合抗菌肽MgJ的高效分泌表达奠定了基础。

1 材料与方法

1.1 材料

大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α、质粒pPICZα A 均由本实验室保存,内切酶、dNTP、T4连接酶、DNA marker、PCR 扩增试剂盒、DNA凝胶回收试剂盒购自TaKaRa宝生物工程有限公司。引物由联星生物合成,其他试剂均为国产分析纯试剂。

1.2 方法

1.2.1 基因的合成

引物设计:根据GenBank中的基因序列,在M基因和J基因中间用铰链ser-ser-gly-se r-gly-ser连接,按照毕赤酵母偏爱密码子表[5]设计合成8个引物,其中Up1含有EcoRⅠ酶切位点,Down2含有XbaⅠ酶切位点。各引物序列见表1。

表1 合成MgJ基因的引物序列Table 1 MgJ primers sequencs

各引物与模板之间的互补关系见图1。

图1 各引物与模板之间的互补关系示意图Fig.1 Complementation of primers

MgJ基因的合成:M1+M2(J1+J2):94℃、5min;94℃、30s,60℃、30s,72℃、30s,每一个循环增加0.2℃,共35个循环;72℃、10min。经电泳检测后割胶回收DNA片段,并命名为M基因。相同条件下J1和J2合成J基因。

Up1-M-Down1(Up2-J-Down2):94℃预变性5min;94℃变性30s、56℃退火30 s、72℃延伸30s;每一个循环增加0.1℃,共30个循环;72℃延伸10min。

全长片段:Up1-M-Down1、Up2-J-Down2互为引物,94℃预变性5min;94℃变性30s、56℃退 火30s、72℃延伸30s;每一个循环增加0.1℃,共30个循环;72℃延伸10min。

以上各PCR体系均为100mL。

1.2.2 目的基因的鉴定目的基因经PCR扩增后,取5μLPCR产物与DNA marker 2.0%琼脂糖凝胶电泳。

1.2.3 表达载体的构建目的基因表达载体的构建策略见图2。

图2 重组质粒pPICZαA-MgJ构建策略Fig.2 Construction of recombinant pPICZα A-MgJ

1.2.4 酶切和连接

目的基因全片段和pPICZα A均用EcoRⅠ和XbaⅠ双酶切,胶回收后,16℃连接过夜。

1.2.5 感受态细胞DH5α的制备和转化

按常规方法操作[6-8]。

1.2.6 阳性克隆的筛选

Zeocin筛选法[9]。

1.2.7 重组质粒的鉴定及DNA序列分析

挑取重组菌培养,提取质粒[10],用EcoRⅠ/XbaⅠ双酶切初步鉴定重组子。DNA序列分析由上海生工生物工程公司完成。

2 结果与分析

2.1 MgJ基因的合成

各引物片断拼接采用重叠PCR扩增出完整的基因。PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测,大小与预计的163bp相符。结果见图3、图4。

图3 目的基因的2%琼脂糖凝胶电泳Fig.3 Agarose gel electrophoresis of genes

图4 MgJ的2%琼脂糖凝胶电泳Fig.4 Agarose gel electrophoresis ofMgJ

2.2 阳性克隆的筛选结果

目的基因PCR扩增产物回收后与pPICZα A载体连接转化至EcoDH5α中,由于EcoRⅠ/XbaⅠ双酶切线性化的pPICZα A不可能自身环化[11-12],因此Zeocin 抗性菌落应含有所需要的重组质粒pPICZα A-MgJ。

2.3 重组质粒的鉴定及测序

将获得的重组质粒pPICZα A-MgJ用EcoRⅠ和XbaⅠ双酶切,经琼脂糖凝胶电泳检测,在相应位置出现条带,表明pPICZα A-MgJ构建成功,结果见图5。测序表明,基因序列与预期相符。

图5 pPICZα A-MgJ双酶切的琼脂糖凝胶电泳Fig.5 Agarose gel electrophoresis of pPICZα A-MgJ digestion

3 结论

抗菌肽必须具备两亲结构和正电荷,较多的正电荷与稳定的两性α-螺旋结合,有助于提高杀菌活性。因此,可利用这一原则来设计新型的杂合抗菌肽[13]。本研究在MagaininⅡ和JaponicinⅡ之间用一段ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性连接肽序列将2个基因相连,以利于增强两段序列的连接,而且还可防止连接的过程中两条序列单独表达互补配对形成二聚体。为了获得抗菌肽MgJ的全长基因片段,本研究采用了重叠区扩增基因拼接法,用互有一段互补序列的8个引物,通过PCR扩增得到了具有EcoRⅠ/XbaⅠ双酶切位点的全长基因。

本研究以pPICZα A作为表达载体。因为pPICZα A即可以在原核细胞中表达,也可在真核细胞中表达,同时其表达盒的N端带有引导分泌的α交配因子(α-MF)信号序列,表达产物可以分泌到细胞外的培养基中[14-15]。由于酵母本身分泌到培养基中的蛋白很少,因此表达上清中的杂质蛋白含量很低,为进一步纯化表达蛋白提供了极大的方便。

研究结果表明,成功地构建了抗菌肽MgJ基因穿梭表达载体pPICZα A-MgJ,为杂合抗菌肽MgJ的高效分泌表达奠定了基础。

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