全基因组序列分析——揭示肿瘤发生发展及个体化治疗的新途径

潘映秋，张 伟，陈枢青 综述

(1.温州医学院附属浙江省台州医院中心实验室，浙江 临海 317000;2.浙江大学药学院药理毒理与生化药学研究所，浙江 杭州 310058)

随着基因组学研究的逐渐深入，人们深刻地认识到人类疾病除外伤外，几乎都与基因相关，研究领域也由有限的遗传疾病扩大到各种常见疾病。其中，肿瘤是一种非常复杂的疾病，其复杂性不仅表现在受多个基因和环境因素的共同影响，还表现于其存在体细胞基因突变和表观遗传调控改变的逐渐积累的过程，而其改变的机制目前尚不明确。全基因组测序分析有助于解开肿瘤发生发展的谜团，为个体化诊治肿瘤找到新的思路。

1 体细胞突变与肿瘤

肿瘤细胞基因组中的体细胞突变包含几种不同类型的DNA 序列的改变:单个碱基的置换;DNA 小片段或者大片段的插入或缺失;基因重排，创建融合基因，破坏DNA，DNA 片段结合至基因组的其他位置;基因组中某些基因的拷贝数异常，可较正常二倍体基因组的2个拷贝数增加或者减少甚至缺失。另外，肿瘤细胞整合外源性DNA 序列。最常见的是整合某些病毒基因，目前已知的可能会导致癌症发生的有人类乳头状瘤病毒、EB 病毒、乙肝病毒等。Woo 等通过分析400 余种肿瘤基因组的体细胞突变，发现单碱基突变是最常见的体细胞突变类型，突变主要发生在细胞分裂S 期，而且肿瘤细胞发生有义突变的比例较生殖细胞高。Sung 等研究了HBV 整合的复发性肝癌的全基因组，发现……