人preproEGF的mRNA/cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究

陈海明 李方明 张 兵 刘祖明 毛贵川 王兴林 刘金伟 杨绍华

1.贵州省黔西南州人民医院遵义医学院第七附属医院，贵州兴义562400；2.遵义医学院附属医院贵州省细胞工程实验室，贵州遵义563000；3.海口市保税区远兮细胞分子技术应用研发有限公司，海南海口570000

人preproEGF的mRNA/cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究

陈海明1李方明1张 兵1刘祖明1毛贵川1王兴林1刘金伟2杨绍华3

1.贵州省黔西南州人民医院遵义医学院第七附属医院，贵州兴义562400；2.遵义医学院附属医院贵州省细胞工程实验室，贵州遵义563000；3.海口市保税区远兮细胞分子技术应用研发有限公司，海南海口570000

目的探明单核苷酸多态（SNPs）在人表皮生长因子前体蛋白（preproEGF）mRNA/cDNA序列中的分布状况。方法凭借美国生物信息中心（NCBI）平台和单核苷酸多态资料库（dbSNP）检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的分布位点和生物信息学特征。结果分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的SNPs总计有106个，其中84个同位SNPs大多数以外显子6～8、11～12、16～19和22～23为间隔并集中归位于第1～5、10、13～15、20～21、24外显子序列中，另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3'端非编码序列中，但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中。结论SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值。

同位单核苷酸多态；人表皮生长因子前体蛋白；非同位单核苷酸多态；生物信息学

人表皮生长因子前体蛋白（prepro-epidermal growth factor，preproEGF）mRNA/cDNA序……