黄鲫线粒体DNA控制区结构及长度多态性分析

蔡珊珊徐胜勇宋 娜高天翔张朝晖

(1. 中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所, 青岛 266003; 2. 国家海洋局第一海洋研究所, 青岛 266061)

黄鲫线粒体DNA控制区结构及长度多态性分析

蔡珊珊1徐胜勇1宋 娜1高天翔1张朝晖2

(1. 中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所, 青岛 266003; 2. 国家海洋局第一海洋研究所, 青岛 266061)

鱼类线粒体DNA(Mitochondrial DNA, mtDNA)因为具有结构简单、严格的母系遗传、缺少重组等特点而成为重要的分子标记[1—4]。线粒体DNA控制区(Control region, CR, 又称D-loop区)是一段非编码区, 进化速率快, 容易积累较多的变异(如碱基的替换、插入和缺失等), 被广泛应用于种内分子遗传学研究[5—7]。控制区一般分为终止序列区、中央保守区和保守序列区3部分。控制区变异多发生于终止序列区, 中央保守区和保守序列区相对保守,且存在多个保守片段(CSB-F、CSB-E、CSB-D、CSB-1、CSB-2、CSB-3等)[7]。目前已分析研究了多种鱼类的线粒体DNA控制区结构[7—15], 并总结归纳出控制区各保守片段的普遍形式[7]。在部分鱼类线粒体DNA控制区中亦发现长度多态性现象[7,14,15], 控制区长度多态性可能应用于种内或种间群体学研究[16]。

黄鲫(Setipinna tenuifilis)隶属鲱形目(Clupeiformes)、鳀科(Engraulididae)、黄鲫属, 广泛分布于印度洋西部和西北太平洋海域, 中国沿海各海域均有分布。黄鲫为近海中下层鱼类, 喜栖息于泥沙底、水流较缓的海区[17,18]。黄鲫是一种小型经济鱼类。20世纪80年代以来, 随着小黄鱼、蓝点马鲛、带鱼等传统经济鱼类资源量下降, 黄鲫的捕获量逐年增加[18]。由于捕捞压力过大, 黄鲫资源量已呈现下降趋势[19—21]。目前对黄鲫的研究主要集中在时空分布、种群结构和生物学等方面[18—22]。……