吉尔吉斯白桦BkWRKY基因克隆与序列分析

田玉富 崔璨 谢龙飞等

摘要从吉尔吉斯白桦转录组文库测序中获得白桦BkWRKY1转录因子的cDNA序列，该序列包含2 189个碱基。序列比对和同源性分析表明，该基因cDNA序列包含1 728 bp的开放阅读框，可编码575个氨基酸，5′非翻译区（UTR）为119 bp，3′非翻译区（UTR）为342 bp。该基因属于WRKY transcription factor家族，含有2个WRKY结构域，蛋白分子量为62.483 kD，理论等电点为7.32，负电荷残基（Asp+Glu）总数为62个，正电荷残基（Arg+Lys）总数为62个。蛋白不含有信号肽，具有一定的亲水性，为亲水蛋白，无跨膜结构。同源性比较与进化树分析表明，吉尔吉斯白桦WRKY蛋白与大豆和蒺藜苜蓿的WRKY蛋白在进化上关系较近。该基因在0.6%NaHCO3胁迫处理后表达量增加，为上调表达基因。

关键词吉尔吉斯白桦；WRKY转录因子；生物信息学分析

中图分类号S188文献标识码A文章编号0517-6611（2014）23-07703-07

基金项目中央高校基本科研业务费专项资金项目（DL12CA13）；东北林业大学大学生创新训练项目（201310225101）。

作者简介田玉富（1991- ），男，宁夏同心人，本科生，专业：林学。*通讯作者，硕士研究生，从事植物资源学领域的研究。

收稿日期20140709在众多的转录因子中，WRKY转录因子是当前研究较为广泛的植物特有的转录因子，最初是从甜马铃薯[1]、野燕麦[2]、欧芹[3]和拟南芥[4]中克隆获得，由于其蛋白含有高度保守的60个氨基酸组成的WRKY结构域而将其命名为WRKY转录因子[5]。WRKY结构域的核心序列靠近氨基（N）末端，由WRKYGQK等7个保守的氨基酸残基组成，能够与基因启动子中的（T）（T）TGAC（C/T）序列（W盒）发生特异性结合，从而调节基因的表达，参与多种与植物生长发育、胁迫应答和物质代谢等有关的重要生理过程；……