丹参作用于水通道蛋白AQP4 的活性成分虚拟筛选

2015-01-13 09:25:20陈少军任纪龙
中成药 2015年2期

陈少军 , 任纪龙

(1. 浙江医药高等专科学校中药系,浙江宁波315000;2. 浙江大学基础医学院生理系神经生理教研室,浙江杭州310000)

丹参为唇形科植物丹参Salvia miltiorrhiza Bunge 的干燥根及根茎,具有活血调经、祛瘀止疼、凉血消痈、除烦安神的功效。现代药理研究表明,丹参具有保护血管内皮细胞、抗动脉粥样硬化、改善微循环、保护心肌、抑制和解除血小板聚集、抑制胶原纤维的产生和促进纤维蛋白的降解、抗脂质过氧化和清除自由基等作用[1]。临床上丹参主要用于治疗心脑血管疾病,是目前活血化瘀药中使用最广泛的一味中药。

中医认为,气血津液生理上同源互化,相互制约,病理上相互为害,一损俱损。丹参同样也会对水液具有一定的调节作用。水通道蛋白(aquaporin,AQPs)是一类特异性跨膜转运水的蛋白,它的正常表达可能是运化水湿、津液输布的分子生物学基础[2]。

因此,作为活血化瘀代表性药物,丹参有可能作用于AQPs 蛋白,如采用传统药理学方法费事费力。本实验利用计算机手段探讨丹参作用于AQP4 的活性成分虚拟筛选,并对其靶标相互作用进行模拟研究。

1 方法与材料

1.1 人工文本数据挖掘 采用人工文本挖掘方式,以丹参、水通道作为检索词,在中国期刊网检索出与之相关的所有文献(检索范围为2013 年5 月16 日前),剔除不含信息的文献,从中提取丹参作用于水通道的文献信息。

采用人工文本挖掘方式,以Salvia miltiorrhiza、aquaporin 作为检索词,从PubMed 中检索出与之相关的文献(检索范围为2013 年5 月24 日前),剔除不相关的文献,从中提取相关文献信息。……

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