PMCI与医学期刊文献的开放存取及数字化存储

2015-09-10 10:07刘树春
中国中医药图书情报 2015年1期

刘树春

摘要:PMC及其与Europe PMC和PMC Canada共同构建的PMCI被公认为是生物医学期刊文献开放存取和数字化存储的成功典范。本文从PMCI的构成、各个镜像节点的创建和功能特点加以讨论,针对PMC与PubMed以及PMCI各节点之间在存储模式和内容上的差异等进行了比较。并提出了在期刊文献开放存取与数字化存储实践中的几点启示。

关键词:PMCI:开放存取:数字化存储:期刊文献

随着生物医学领域相关研究的飞速发展,信息更新日趋频繁。而生物医学期刊的开放存取和数字化存储,顺应了网络时代学术文献信息快速与广泛交流的需要,促进了生物医学科研信息的传播与国际研究合作,同时也进一步扩大了学术期刊的使用范围,提高了期刊的使用率和学术影响力。

在生物医学领域,PubMed Central(PMC)以及以PMC为基础组建的PMC International(PMCI)被公认为是医学期刊文献开放存取的成功典范,同时也是生物医学期刊文献数字化仓储国际化合作的先驱。

1 PMCI及其成员中心

PMCI是由美国国家卫生研究院(NationalInstitute of Health,NIH)和国立医学图书馆(National Librarv of Medicine,NLM)、文献来源期刊的出版社,以及其他国家共享NLM存储文献的组织机构共同协作创建的。NLM目前支持两个PMCI中心,即Europe PubMed Central(Europe PMC)和PubMedCentral Canada (PMC Canada)。二者与位于美国的PMC共同构成PMCI。两个中心也分别是PMC在英国和加拿大的镜像站,接受和同步共享PMC的内容。

PMCI是NLM的国家生物技术信息中心(NationalCenter for Biotechnology Information, NCBI)与PMCI的各个节点(Europe PMC和PMC Canada)及在PMC存储期刊论文的出版社之间的合作项目,其长期目标是建立数字文献存储网络,并在网络内部共享各自存储的内容,以类似于国际核酸序列数据库合作联盟(GenBank/EMBL/DDBJ)的模式对数据进行存储和交换。作为一个生物医学文献数字仓储库,其核心原则是:即使随着技术的发展可能导致数字文献的格式发生变化,但其收录的全部期刊文献必须提供永久性的免费访问。

1.1 PubMed Central

PMC(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/或http://www.pubmedcentral.gov/)创建于2000年2月,是一个由NLM的NCBI开发与维护的开放存取式生物医学及生命科学期刊文献档案库。在其起步阶段,仅有美国的PNAS(《美国国家科学院汇刊》)等少量期刊加入。经过十几年的发展,已经有超过2000种期刊加入到PMC的开放存取和数字仓储行列中,全文文献超过330万篇,成为全球生物医学领域规模最大的开放存取机构仓储。2009年,美国总统奥巴马签署了年度《综合拨款法案》,使NIH公共存取政策成为一项永久制度。其条款规定:在遵守版权法的情况下,NIH要求受NIH资助的所有研究者在研究成果正式发表后的12个月之内将其被期刊接受发表的经同行评议的稿件终稿电子版提交至PMC数字仓储中,并向公众开放访问。

1.2 Europe PubMed Central

Europe PMC(http://europepmc.org/)原名为UKPubMed Central(UKPMC),是由维康信托基金会(Wellcome Trust)发起,并由欧洲生物信息学研究所、曼彻斯特大学及大英图书馆在PMC的基础上共同开发维护的生物医学及生命科学免费数字文献存储库,现受到包括维康信托基金会在内来自于欧洲的24个慈善和政府组织等生命科学及生物医学基金会的支持。2006年,Wellcome Trust宣布,凡是由其资助的研究论文必须在发表后的6个月内通过UKPMC免费向网络开放。2007年1月,UKPMC作为PMCI的一部分和PMC在英国的镜像站正式上线。

2012年7月13日,欧洲学术研究委员会(TheEuropean Research Council,ERC)宣布加入到已经有18个英国和欧洲的基金会支持的UKPMC中。正是由于ERC的加入,以及为了扩展该存储库的服务范围,UKPMC在2012年11月1日改为Europe PMC。

1.3 PubMed Central Canada

PMC Canada(http://pubmedcentralcanada.ca/)作为PMC在加拿大的镜像站点和PMCI数字存储网络的一部分,是在PMC的基础上建立的,由加拿大国家科学图书馆(NRC-CISTI)维护,并与加拿大卫生研究所(CIHR)及美国的NLM建立合作伙伴关系,其目的是基于在加拿大的文献库向用户永久性提供高质量的生物医学及生命科学研究文献的全文免费访问。

PMC Canada全面支持CIHR的开放存取政策,并要求CIHR基金资助者在论文发表后的6个月内通过PMC Canada向网络开放。目前,PMC Canada只接受CIHR资助的作者提交的经同行评议的期刊论文,以后还要扩展接受加拿大其他基金资助机构的研究文献,使位于加拿大的公共开放文献库的价值最大化。

2 创建PMCI网络的原因

PMCI的创立,是NLM和世界各国与PMC具有共同目标的机构建立合作关系,在其他可信的国际文献档案库以相同的原则维护PMC的文献,最大限度地避免文献资料的损坏和遗失。

创建PMCI主要是基于以下原因。第一,如果在世界各地的多个站点上存在活动的档案副本被用户正常使用,就可能加大文献档案的长期存活可能性。第二,研究文献的生产者和资助者更习惯于将其文献资料存储于本地或区域性档案库,而不是在世界其他地方的档案库。第三,每个站点可以将档案库中的期刊论文与其他相关的资源进行整合,如:对用户具有特殊意义的特定国家或地区性的临床指南等。同时,网站的多样性也可以尽可能达到更大的创新,确保PMC的长期持久性。