基于微卫星的泥蚶5个地理群体遗传多样性分析

程雪艳, 滕爽爽 , 肖国强 , 邵艳卿 , 张炯明 , 方 军 , 柴雪良

(1. 温州医科大学 检验医学院 生命科学学院, 浙江 温州 325035; 2. 浙江省海洋水产养殖研究所, 浙江 温州 325005; 3. 浙江省近岸水域生物资源开发和保护重点实验室 浙江 温州 325001)

泥蚶(Tegillarca granosa)属软体动物门(Mollusca)、双壳纲(Bivalvia)、蚶目(Arcoida)、蚶科(Arcidae), 是一种栖息于沿海滩涂的广温广盐性双壳贝类, 在我国主要分布于山东以南沿海[1], 是我国主要的养殖经济贝类之一, 具有很高的经济价值。但近年来, 过度釆捕和生态环境的改变对泥蚶的自然资源造成严重的破坏。人工养殖的泥蚶种质大多是未经遗传改良的野生型, 在经过多年累代养殖后,已出现种质退化等制约泥蚶养殖业持续健康发展的现象[2]。因此, 有必要对泥蚶遗传背景进行深入调查研究, 为泥蚶自然资源的恢复和遗传改良奠定理论基础。

目前, 对于泥蚶群体的遗传多样性的研究涉及形态学水平[1,3]、同工酶水平[4-5], DNA分子水平[3,6-8]等方面。微卫星标记(microsatellite)广泛分布于真核生物基因组中, 由 2～6个核苷酸的串联重复片段构成。又称为简单重复序列(simple sequence repeats)或短串联重复序列(simple tandem repeats, STRs)[9]。由于具有数量丰富、多态性丰富、共显性标记、实验重复性好以及结果可靠等优点[10], 被广泛应用于物种的种群遗传结构和遗传多样性分析。在水产动物种群遗传结构的分析中已被广泛使用, 如海湾扇贝(Argopecten irradias)[11]、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)[12]、文蛤(Meretrix meretrix)[13]、长牡蛎(Crassostrea gigas)[14]、缢蛏(Sinonovacula constricta)[15-16]、马氏珠母贝(Pinctada fucata)[17]、斧文蛤(Meretrix lamarckii)[18]等。

本研究采集了韩国以及我国沿海地区 5个地理群体泥蚶, 利用本实验室开发的泥蚶 SSR引物对 5个群体进行比较分析, 对泥蚶的遗传多样性水平进行评估, 为更好地开发利用该物种生物资源提供理论基础。……