基于生物信息学技术分析老年人颈动脉不稳定斑块差异基因表达谱

基于生物信息学技术分析老年人颈动脉不稳定斑块差异基因表达谱

奈文青丁宇张克伟1王媛媛单兰兰傅友吴洪渊丁燕戴萌

(南方医科大学南方医院，广东广州510515)

摘要〔〕目的探讨老年患者颈动脉不稳定斑块发生的分子机制。方法从ArrayExpress数据库下载基因表达谱数据集E-MTAB-2055。该数据包含24例颈动脉不稳定斑块和24例稳定斑块，分别来源于24例老年颈动脉粥样硬化患者。通过系列数据分析从中筛选差异表达基因，并通过富集分析获取与不稳定斑块有关的生物学过程和通路。同时，通过构建差异表达基因的生物网络寻找与该疾病高度相关的风险模块。结果不稳定斑块中发生显著性差异表达变化的基因共有439个，其中上调基因为232个，下调基因为207个。涉及到的生物学过程和通路大部分与炎症和免疫应答有关。生物网络和模块分析提示CXCR4、VCL和TYROBP 可能在老年患者不稳定斑块发生发展过程中发挥着重要作用。结论本研究比较完整地揭示了老年患者颈动脉不稳定斑块差异表达谱特征和涉及的生物学过程及信号通路，其中CXCR4、VCL和TYROBP可能参与不稳定斑块发生发展。

关键词〔〕不稳定斑块；动脉粥样硬化；基因表达谱；差异表达基因；生物信息学

中图分类号〔〕R543.4〔文献标识码〕A〔

基金项目：南方-哈佛“健康医疗云服务”平台关键技术创新、集成与应用(2013J4500040穗科信字〔2013〕184号)

通讯作者：戴萌(1963-)，女，博士，教授，硕士生导师，主要从事血管衰老早期干预研究。

1河南省人民医院

第一作者：奈文青(1988-)，女，在读硕士，主要从事动脉粥样硬化早期干预研究。……