黄颡鱼cGnRH基因的筛选鉴定及生物信息学分析

王乐，卢建国，王平平，栾培贤，王秋实，孙效文

（中国水产科学研究院黑龙江水产研究所，黑龙江 哈尔滨150070）

黄颡鱼cGnRH基因的筛选鉴定及生物信息学分析

王乐，卢建国，王平平，栾培贤，王秋实，孙效文

（中国水产科学研究院黑龙江水产研究所，黑龙江 哈尔滨150070）

本研究在前期已获得的黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco转录组基础上，利用BLAST程序从中筛选获得黄颡鱼cGnRH基因的候选序列，再通过氨基酸序列分析从中筛选获得cGnRH的全长cDNA为261bp，编码86个氨基酸，其核心十肽的序列为QHWSHGWYPG，相对分子质量为9 755.5、理论PI值为9.02。序列同源比对发现：黄颡鱼与斑马鱼Danio rerio、草鱼Ctenopharyngodon idella、鲤Cyprinus carpio中cGnRH氨基酸的相似性分别高达70.93%、68.60%和67.44%。用MEGA构建的黄颡鱼与其他27种硬骨鱼cGnRH的Neighbour-joining进化树发现，黄颡鱼cGnRH先与脂鲤科的墨西哥丽脂鲤Astyanax mexican共聚类，再依次与鲤科的斑马鱼、草鱼、黑头呆鱼Pimephales promelas、稀有鮈鲫Gobiocypris rarus等鱼的cGnRH序列聚类。本研究首次筛选获得黄颡鱼的cGnRH序列，并利用生物信息学软件进行鉴定分析，为后续的基因表达和cGnRH调节生长生殖作用的研究提供序列资源及基础。

黄颡鱼；促性腺激素释放激素；序列分析

黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco主要产于长江支流，广泛分布于长江、黑龙江、珠江等内陆水域[1]。黄颡鱼肉质细嫩鲜美，无肌间刺，富含蛋白质，是一种重要的淡水鱼类，深受消费者喜爱的美味，具有重要的经济价值，在日本、韩国、东南亚等国家亦有巨大的市场，是出口创汇的优良鱼类[2]。但由于其生长较为缓慢，雌鱼更甚，限制了黄颡鱼的养殖及推广[3]。

促性腺激素释放激素（Gonadotropin-releasing hormone，GnRH）是一个保守的神经家族，具有调节生物性腺发育和诱导性成熟的作用。……