基于宏基因组学的成年和老年袋鼠肠道菌群多样性和差异性研究

高云航，徐佳萍，赵晗旭，邸海洋，王　巍，娄玉杰，马红霞（.吉林农业大学动物科技学院，吉林长春08；.中国农业科学院特产研究所，吉林长春0；.长春动植物公园，吉林长春006）



基于宏基因组学的成年和老年袋鼠肠道菌群多样性和差异性研究

高云航1，徐佳萍2，赵晗旭1，邸海洋3，王巍1，娄玉杰1，马红霞1
（1.吉林农业大学动物科技学院，吉林长春130118；2.中国农业科学院特产研究所，吉林长春130112；3.长春动植物公园，吉林长春130062）

摘要：为了了解袋鼠粪便中菌群的多样性，分析成年和老年袋鼠粪便中菌群的差异性。应用高通量测序技术测定成年和老年袋鼠粪便细菌16S rDNA的V3-V4变异区序列，应用Prinseq和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元（OTUs）数量，分析菌群物种丰度、分布和Alpha多样性。获得成年袋鼠粪便（AK）的OTU数为7 210，老年袋鼠粪便（OK）的OTU数为6 120。AK和OK的丰富度指数分别为4 377.028/7301.574和1 430.718/1858.623，香农指数分别为6.275和4.273。AK和OK肠道优势菌群均隶属厚壁菌门，分别占65%（AK）和78%（OK），除此之外，共有优势菌门还有变形菌门、拟杆菌门和螺旋菌门，但AK有四种独有菌门。获得了成年和老年袋鼠粪便中细菌的丰富度、菌群结构及差异性。

关键词：袋鼠；肠道菌群；宏基因组学

袋鼠是典型的草食动物，是研究哺乳动物较好的动物比较模型。袋鼠前肠具有独特的消化功能，可进行高效能量转换，被广泛认为是低甲烷排放动物[1]。由于影响袋鼠的疾病主要为口腔疾病和消化道疾病[2]，因此，开展不同年龄袋鼠粪便中细菌多样性的研究和菌群结构的分析可为深入研究单胃食草野生动物消化道菌群提供理论基础，进而为减缓动物老龄化以及动物消化道疾病的防控提供新思路。……