土壤微生物多样性的研究方法

李洁，李睿玉，杨红，马丹炜，全津莹，雷波

（1.四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所，四川成都610066；2.四川师范大学生命科学学院，四川成都610101）

土壤微生物多样性的研究方法

李洁1，李睿玉2，杨红1，马丹炜2，全津莹1，雷波1

（1.四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所，四川成都610066；2.四川师范大学生命科学学院，四川成都610101）

对土壤微生物多样性的研究方法进行了综述。其中，微生物平板记数法仅能简单反映样品中微生物的类型和数量；从生化方面研究微生物多样性的方法主要包括基于底物利用率的代谢图谱以及磷脂脂肪酸生物标记法；土壤微生物在基因水平上的多样性可以用PCR-DGGE和PCR-TGGE技术、单链构象多态性分析（SSCP）、限制性片段长度多态性（RFLP）和末端限制性片段长度多样性（T-RFLP）等进行研究。荧光原位杂交可通过寡核苷酸探针和全细胞杂交进行原位鉴定和计算单个微生物细胞。目前，基因芯片技术已在微生物检测和群落分析中获得了很大关注，而高通量测序技术使得对土壤微生物转录组和基因组进行全面分析成为可能。

土壤微生物；多样性；研究进展

土壤微生物多样性包括在栖息地中微生物分类群的多样性和在微生物分类群内的遗传多样性以及群落结构的变异性、相互作用的复杂性、营养水平（tropic level）和共位群（guild）数量（功能多样性）在内的生态多样性[1]。目前，对土壤微生物多样性的研究已从传统的微生物平板计数法发展到高通量测序技术，从仅能对土壤微生物类型和数量测定发展到能对几十万到几百万条DNA分子进行序列测序，使得对一个物种的转录组和基因组进行全面分析成为可能[2]。……