田旭飞, 曲 波
沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁 沈阳 110866
DNA条形码在入侵植物鉴定中的应用进展
田旭飞, 曲波*
沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁 沈阳 110866
摘要:生物入侵对世界经济、环境造成了巨大的影响,已经成为世界关注的焦点。传统的海关检验方法存在鉴定缓慢、准确率低、鉴定专家稀缺等问题,因此急需一种鉴定率高、操作简单和快速的方法对入侵植物的繁殖体进行精确的鉴别。DNA条形码是一种基于DNA序列差异进行物种鉴定的技术,鉴定结果只受样品组织内DNA保存状况影响,不受形态学性状保存状态影响,只需掌握简单分子生物学技术的工作人员即可实现对未知样品的鉴定,在入侵植物检疫鉴定中有很大的应用潜力。根据入侵植物进化快、变异多的特点,可优先考虑种间、种内差异度高的ITS基因作为核心条形码,再以matK和rbcL基因为辅助条形码。本文分析了植物DNA条形码技术及其衍生出的超级DNA条形码和metabarcoding技术在入侵植物鉴定中的应用潜力,提出构建入侵植物DNA条形码参考数据库与智能植物志(iFlora)相结合,为利用DNA条形码技术对入侵植物进行快速鉴定和相关研究提供参考。
关键词:DNA条形码; 入侵植物; 超级DNA条形码; metabarcoding; 智能植物志
生物入侵已经成为一个极其严峻的问题,如今甚至可以和能源问题相提并论,成为世界难题,每年给世界造成巨大的经济损失(李振宇和解焱,2002; Pimenteletal.,2000)。入侵植物一般具有强大的适应能力,在自然条件下比本地植物的生存和繁殖能力更强,基本都能快速扩散形成单优群落,占据生态位,导致当地生物多样性下降甚至丧失,严重威胁生态健康;……