张依德 王远亮
(重庆大学生物工程学院 重庆 400044)
MCM与核心组蛋白基因的负相关表达模式的初步探讨
张依德 王远亮
(重庆大学生物工程学院 重庆 400044)
本研究采用了荧光定量PCR技术,用稳定表达的管家基因为内参基因,分析MCM及核心组蛋白家族基因负相关模式的动态表达情况,以探索它们之间的关系,以期为基因的负相关表达模式提供支持。结果显示:两组基因在细胞周期中不论何时上调或下调,只要一组基因出现上调,另一组基因总是出现下调的情况,也就是说两组基因的表达模式总是相反的。Clb-Cdk1激酶在MCM基因和核心组蛋白基因的转录过程中扮演着极其重要的角色,它可以调控两组基因的表达,是导致两组基因呈负相关模式关键点。
酿酒酵母 负相关模式 细胞周期 荧光定量PCR
对于基因调控网络的构建都是在识别相似表达基因或正相关表达基因的相互作用,而当前的研究发现,一个或多个基因表达的表达上调或者下调同时会导致其上游或下游一个或多个基因表达的改变,据此提出“负相关模式”这一概念。本课题组就此模式提出NCFCA算法,并将其应用于研究酿酒酵母细胞周期的基因表达谱,发现微小染色体维持蛋白基因与核心组蛋白基因可能符合负相关模式概念。
对两组基因进行GO功能富集分析,结果显示它们都具有多种相似功能,主要体现在共同参与DNA构象变化、蛋白质-DNA复合物的组装、细胞成分的组装和合成等。因此我们对这两组基因在酵母细胞周期中的表达情况进行具体探讨与研究。……