青天葵DXR基因编码蛋白的生物信息学分析

黄琼林，何 瑞，詹若挺

（1．广东医学院，广东湛江524023；2．广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心，广东广州510006；3．岭南中药资源教育部重点实验室，广东广州510006）

青天葵DXR基因编码蛋白的生物信息学分析

黄琼林1，何 瑞2，3＊，詹若挺2，3

（1．广东医学院，广东湛江524023；2．广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心，广东广州510006；3．岭南中药资源教育部重点实验室，广东广州510006）

为后期青天葵DXR基因的全长克隆、功能鉴定和调控研究奠定基础，采用生物信息学方法对前期通过转录组测序获得的青天葵DXR基因编码蛋白序列进行分析。结果表明：NfDXR序列包含457个氨基酸，分子量约为49．72Ku，为亲水性、混合结构型蛋白质。NfDXR属于1－脱氧－D－木酮糖－5－磷酸还原异构酶超级家族，含有DXR功能域、2个NAPDH结合基序和2个DXR活性位点基序，不具有跨膜结构域和信号肽结构。NfDXR与其他单子叶植物DXR同源性高，其中与铁皮石斛DXR的序列相似度达90%。

1－脱氧－D－木酮糖－5－磷酸还原异构酶；青天葵；生物信息学

1－脱氧－D－木酮糖－5－磷酸还原异构酶（1－deoxy－D－xylulose－5－phosphate reductoisomerase，DXR）是植物萜类生物合成途径——MEP途径的关键酶基因之一［1］。研究发现［2－3］，过表达DXR基因可以提高植物萜类化合物的含量，表明DXR基因是调控萜类生物合成的有效靶点。目前，DXR基因已经从阳春砂［4］、高良姜［5］、秦艽［6］、雷公藤［7］、滇龙胆［8］等药用植物中成功克隆。

岭南地区名贵中药青天葵为兰科多年生草木植物毛唇芋兰（Nervilia fordii（Hance）Schltr．）的全株或叶片，在临床上常用于治疗小儿呼吸道和肺部疾病［9］。目前，青天葵野生资源已经基本枯竭，而人工栽培青天葵由于面临萌发条件苛刻、种苗稀缺等瓶颈问题，无法生产足够的青天葵满足临床和市场需求。……