人类蛋白组学草图的肺癌分子标记物初探

朱琰琰，罗执芬，崔永霞，卢创新，周　云*

(1．河南省人民医院肿瘤科， 郑州 450003；

2．郑州大学人民医院肿瘤科， 郑州 450003)



人类蛋白组学草图的肺癌分子标记物初探

朱琰琰1,2，罗执芬1,2，崔永霞1,2，卢创新1,2，周云1,2*

(1．河南省人民医院肿瘤科， 郑州 450003；

2．郑州大学人民医院肿瘤科， 郑州 450003)

摘要：传统的肺癌分子标记物探索通常基于基因组或者转录组研究，而基于蛋白质水平的肺癌分子标记物探索通常局限在低通量水平。 质谱技术已经开始产生高通量的全局正常及癌症蛋白组。我们采用开源统计软件R对人类蛋白组学草图数据及已发表的肺癌蛋白质组学数据进行二次分析，筛选出91个潜在的候选肺癌分子标记物。基因注解分析显示候选肺癌基因富集了和代谢、TP53通路以及MicroRNA调控等相关的基因。最后，利用Human Protein Atlas数据库及Pubmed对前20候选标记物进行验证, 结果显示大部分候选肺癌基因大多能够得到验证。可见数据挖掘在即将到来的质谱推动的组学大数据时代将发挥重要作用。

关键词：蛋白质组；数据挖掘；肺癌；分子标记物

人类基因组草图的发表迄今已经有15年。在这期间，测序技术的不断成熟以及成本的不断下降促使基因组学在生物医学研究中占据举足轻重的作用[1]。基因微芯片技术以及RNA测序则推动了我们对于基因在RNA水平表达的认识[2, 3]。基于转录组学数据的研究使我们得以发现很多在疾病发生发展中起重要作用的生物标记物，比如肿瘤生物标记。由于技术的限制，我们对于人类蛋白组学的认识一直处于相对落后的状态。……