袁 芳,甄梓娟,徐元江,兰小中*
(1 西藏大学 农牧学院,西藏林芝 860000;2 西藏大学 农牧学院-西南大学药用植物联合研发中心,重庆 400715)
西藏八角莲与桃儿七根及根茎SSH文库的建立
袁芳1,2,甄梓娟1,徐元江1,兰小中1,2*
(1 西藏大学 农牧学院,西藏林芝 860000;2 西藏大学 农牧学院-西南大学药用植物联合研发中心,重庆 400715)
摘要:以西藏八角莲(Dysosma tsayuensis Ying)和桃儿七[Sinopodophyllum hexandrum (Royle) Ying]为材料,构建其根及根茎的SSH文库,从中筛选鬼臼类植物属种间与鬼臼毒素生物合成相关的差异表达基因。从文库中随机挑取201个阳性克隆测序后得到183条ESTs。去除载体序列和冗余序列,聚类拼接得到17个西藏八角莲的unique ESTs。经BLAST同源比较和功能查寻,有功能注释的unique ESTs共12个,占70.6%,所编码的蛋白涉及光合作用、合成代谢、转录调控等功能;无功能注释和匹配结果的共5个,占29.4%。该研究成功构建了西藏八角莲和桃儿七SSH文库,为进一步揭示鬼臼毒素生物合成途径及其调控机制奠定了基础。
关键词:西藏八角莲;桃儿七;SSH文库;鬼臼毒素;EST
鬼臼类植物隶属于小檗科(Berberidaceae),包括八角莲属(DysosmaWoodson)、足叶草(鬼臼)属(PodophyllumL.)、桃儿七属(SinopodophyllumYing)和山荷叶属(DiphylleiaMichx.)[1-2]。鬼臼类植物是一类具有显著生物活性,又具有悠久应用历史的药用植物。中国汉代的《神农本草经》中就有鬼臼的记载,在以后的本草典籍中亦多记载,鬼臼类植物主要用于治疗蛇咬伤、痈疖肿毒、跌打、风湿筋骨痛及气管炎等症[3-4]。鬼臼类植物的活性成分主要为木脂素类化合物,其中鬼臼毒素具有高效抗肿瘤活性,已作为合成多种抗癌药物的前体物质[5-10]。……