广西鹅圆环病毒全基因组序列测定

曹慧慧 孙文超 郑敏 韦显凯 苏姣秀 蒙振亩 黄宝学 刘棋

摘要：【目的】解析鹅圆环病毒（Goose Circovirus，GoCV）广西流行毒株的全基因组序列及其遗传进化地位，掌握广西GoCV的流行情况，为今后更有效防控GoCV提供理论依据。【方法】分3段对阳性组织样品中的GoCV全基因组进行PCR扩增、克隆和测序，并对拼接得到的GoCV广西流行毒株全基因组进行核苷酸组成、基因组结构及遗传变异分析。【结果】GoCV广西流行毒株（GXTD254）全基因组长度为1822 nt，编码4个主要开放阅读框：ORF V1（Rep蛋白，293个氨基酸）、ORF V2（37个氨基酸）、ORF C1（Cap蛋白，250个氨基酸）和ORF C2（99个氨基酸），且Rep蛋白较Cap蛋白相对保守。遗传进化分析结果表明，GXTD254毒株与4株浙江永康分离毒株（ZJyk1、ZJyk2、ZJyk3和ZJyk4）、1株浙江象山分离毒株（ZJxs1）的遗传距离最接近，同属于一个遗传分支，但与我国台湾的大多数分离毒株（TW1021024G、TWGB21-9、TW6、TW9、TW8和TW1020111GB）及另外2株浙江象山分离毒株（ZJxs3和ZJxs5）的遗传距离较远。【结论】目前我国流行的GoCV存在多个分支，广西流行毒株与部分浙江分离毒株在亲缘关系上比较接近。

关键词： 鹅圆环病毒；全基因组；序列分析；Rep蛋白；Cap蛋白

中图分类号： S858.33 文献标志码：A 文章编号：2095-1191（2016）01-0122-06

0 引言

【研究意义】鹅圆环病毒（Goose Circovirus，GoCV）属于圆环病毒科（Circoviridae）圆环病毒属（Circovirus）成员，是无囊膜的二十面体病毒粒子，其直径约20 nm，为目前已知的最小鹅源病毒（竺春等，2007）。与猪圆环病毒（Porcine Circovirus，PCV）和鸭圆环病毒（Duck Circovirus，DuCV）等同属成员相似，GoCV也是一种潜在的免疫抑制病毒，主要侵害宿主的淋巴组织，导致宿主免疫抑制，生长迟缓，且增加继发感染的可能性，给鹅养殖业带来极大的经济损失（Chen et al.，2003）。因此，加强GoCV的相关研究对确保鹅养殖业健康发展具有重要意义。……