应用改良的方法检测常染色体显性遗传多囊肾基因突变

2016-06-01 12:20:11张明超刘帅妹何群鹏朱培冉1李卫巍吴秋月夏欣一1
肾脏病与透析肾移植杂志 2016年4期
关键词:基因突变检测

张明超 刘帅妹 何群鹏 朱培冉1, 李卫巍 吴秋月 夏欣一1,

应用改良的方法检测常染色体显性遗传多囊肾基因突变

张明超1,3刘帅妹2何群鹏3朱培冉1,2李卫巍2吴秋月2夏欣一1,2

目的:常染色体显性遗传性多囊肾(ADPKD)是常见的遗传性肾脏疾病,主要是由PKD1和PKD2基因突变引起的。其中,PKD1包含46个外显子,编码区域大概为13 kb,而PKD2有约3 kb的编码区域,含有15个外显子。然而传统的ADPKD基因检测方法繁琐、费时,本研究即旨在建立方便快捷的突变筛查方法。 方法:根据临床和实验室检查入选3个互不相关的中国汉族ADPKD家系。利用新一代测序技术(NGS),针对PKD1和PKD2外显子,剪接位点和10 bp内含子侧翼序列进行基因芯片捕获,检出的变异经过筛选,并与单核苷酸多肽数据库进行比对。 结果:通过与人类基因突变数据库核对,本研究新鉴定的PKD1中c.7318delG,c.5884C>T和继往报道的PKD2中c.916C>T杂合变异可能是这3个家系的致病性突变。PCR联合Sanger序列分析证实家系中上述杂合突变的存在,在家系中呈现基因型与表现型共分离;并分别导致PKD1编码的氨基酸发生移码(p.Asp2440Thrfs*180)及无义突变引发PKD1(p.Gln1962*)和PKD2(p.Arg306*)蛋白的提前中止。 结论:我们利用NGS技术建立了快速分析ADPKD遗传变异的方法,并成功应用于3个家系,鉴定两个新发突变,可作为疑似ADPKD及家系成员的常规筛查手段。

常染色体显性遗传性多囊肾 PKD1 PKD2 新一代测序技术

常染色体显性遗传性多囊肾(ADPKD)是常见的单基因遗传性肾脏疾病,全世界发病率为1/400~1/1 000,该病主要临床表现为双侧肾脏形成液性囊泡,囊肿进行性增大,造成肾脏结构和功能的损害,最终导致终末期肾病(ESRD)[1-2]。

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