一株缬草根际稀有放线菌的分离鉴定及其天然产物生物合成基因的筛查

安晓英，马怡茗，刘香香，周童娜，颜　华，贾良辉

(西北农林科技大学 生命科学学院，陕西杨凌　712100)

一株缬草根际稀有放线菌的分离鉴定及其天然产物生物合成基因的筛查

安晓英，马怡茗，刘香香，周童娜，颜华，贾良辉

(西北农林科技大学 生命科学学院，陕西杨凌712100)

采用梯度稀释涂布平板法分离缬草根际土壤中的放线菌，从高氏一号培养基上分离得到1株放线菌BJA-103，对该菌形态特征、培养特征、生理生化特征及16S rDNA基因序列进行鉴定，并用简并PCR方法对其多种天然产物生物合成关键酶基因进行筛查。经分类鉴定，初步确定BJA-103为Amycolatopsiscoloradensis的一个菌株；PCR筛查结果显示，该菌株含有非核糖体肽合酶(NRPS)、Ⅰ型聚酮合酶(PKS-Ⅰ)、Ⅱ型聚酮合酶(PKS-Ⅱ)以及糖肽类抗生素合成关键酶P450单加氧酶的基因。

稀有放线菌；分类鉴定；16S rDNA；抗生素生物合成基因

缬草隶属败酱科(Valerianaceae)缬草属(Valeriana)多年生草本，全世界约有250余种，中国约有28种，主产于西南、西北和东北地区。缬草的根及根茎用于镇静安眠和解挛止痛[1-2]。植物根际是指生物和物理特性受到植物根系影响的紧密环绕根的区域，通常指距离根表面1～4 mm，甚至更小的区域。在植物根际区域内生长的微生物称为根际微生物。根际是土壤-植物生态系统物质交换的活跃界面。研究表明，根际放线菌产生抗菌抗生素和其他活性物质的比例显著高于根际周围土壤来源的放线菌[3]。因此，从根际微生物的代谢产物中寻找生物活性物质是人们从大自然中探寻宝藏的又一条途径。……