胡振帮,高运来,齐照明,蒋洪蔚,刘春燕,辛大伟,胡国华,潘校成,陈庆山
(1东北农业大学农学院,哈尔滨150030;2黑龙江省农垦科研育种中心,哈尔滨150090;365301部队副业基地,黑龙江五大连池164100)
作物分子身份证构建软件ID analysis的编制
胡振帮1,高运来1,齐照明1,蒋洪蔚2,刘春燕2,辛大伟1,胡国华2,潘校成3,陈庆山1
(1东北农业大学农学院,哈尔滨150030;2黑龙江省农垦科研育种中心,哈尔滨150090;365301部队副业基地,黑龙江五大连池164100)
摘要:【目的】以作物品种或资源的SSR分子标记为基础数据,应用Visual Basic6.0开发作物分子身份证构建配套软件ID analysis,快速准确地筛选引物组合并高效鉴定品种。【方法】作物分子身份证理论由陈庆山提出,其原理是利用SSR标记在材料中的多态性特点,将多个标记进行排列组合,快速有效地区分品种资源的算法——逐步扩增法。通过对40份黑龙江省大豆品种的40对引物数据进行分子身份证构建,阐述该软件的详细操作过程。【结果】利用 Visual Basic6.0编程软件设计人机交互界面,通过编程实现核心算法,开发 ID analysis软件,软件集成全库构建、部分构建、ID判定、数据合并等功能。其中,全库构建是软件的核心功能,通过全库构建可以快速分析区分材料的最少标记;部分构建可以选择部分目标材料进行区分;ID判定可以在分子身份证数据库构建完成的前提下,对未知材料进行SSR分析,根据获得的分子身份证数据来确定材料是哪个品种或近似品种;数据合并功能可以将多次试验数据整合成一个数据集。利用软件全库构……