牛PRKAA2基因SNP检测及与其生长和肉质性状的关联分析

田万强,梅楚刚,付常振,辛亚平,张　松,王国庆,昝林森,3

(1 杨凌职业技术学院 动物工程分院，陕西 杨凌 712100；2 西北农林科技大学 动物科技学院，陕西 杨凌 712100；3 国家肉牛改良中心，陕西 杨凌 712100)



牛PRKAA2基因SNP检测及与其生长和肉质性状的关联分析

田万强1,2,梅楚刚2,付常振2,辛亚平2,张松2,王国庆2,昝林森2,3

(1 杨凌职业技术学院 动物工程分院，陕西 杨凌 712100；2 西北农林科技大学 动物科技学院，陕西 杨凌 712100；3 国家肉牛改良中心，陕西 杨凌 712100)

[摘要]【目的】 研究秦川牛、南阳牛、鲁西牛和安格斯牛共630头个体的单磷酸腺苷激活的蛋白激酶α2亚基(AMPKα2)基因PRKAA2的多态性，并分析其多态性与200头秦川牛生长及肉质性状的关联性。【方法】 利用PCR-SSCP、DNA测序、飞行质谱(MALDI-TOF)等技术，分析检测4个品种牛PRKAA2基因6个外显子的单核酸多态性(SNPs)；采用生物信息学方法结合统计分析软件，分析秦川牛各多态位点的遗传变异特性与体尺及肉质性状的关联性。【结果】 PRKAA2基因第2、4、6、7、8、9外显子中，只检测到第4外显子27 G>C和60 T>C 2个突变位点；关联分析表明，27 G>C位点与秦川牛背膘厚和眼肌面积显著关联(P<0.05)；60 T>C位点与秦川牛体斜长极显著相关(P<0.01)，与体高、尻长、腰角宽、坐骨端宽、眼肌面积显著相关(P<0.05)。【结论】 PRKAA2基因对秦川牛部分体尺及肉质性状有极显著或显著影响，可作为秦川肉牛新品种早期选择的候选基因和分子辅助标记。

[关键词]秦川牛；PRKAA2基因；单核酸多态性(SNPs)；体尺性状；肉质性状

在动物生产中，家畜自开始驯化就受到集中选择，特别是关于生长、发育、繁殖、行为和对疾病的抵抗力等性状[1]。近年来，随着分子育种技术的成熟，标记辅助选择(Marker assisted selection, MAS)方法已成为育种工作者对家畜重要经济性状进行标记选择进而提高育种效率的有效途径[2]。

哺乳动物单磷酸腺苷活化蛋白激酶(AMPK)是一个异源三聚体蛋白质，其组成亚基有α、β、γ 3种[3-6]。已知的……