软体动物牡蛎肌联蛋白一级结构的预测

包玉龙，张三润，徐宋瑶，周好乐

（内蒙古医科大学基础医学院，内蒙古 呼和浩特 010110）

软体动物牡蛎肌联蛋白一级结构的预测

包玉龙，张三润，徐宋瑶，周好乐

（内蒙古医科大学基础医学院，内蒙古 呼和浩特 010110）

旨在预测牡蛎肌联蛋白的基因exon-intron结构，并确定其一级结构及结构域。利用生物信息学方法，从牡蛎基因组数据中预测肌联蛋白基因的exon-intron结构，并进一步预测编码肌联蛋白的mRNA组成，从而确定该蛋白的一级结构，并检测其结构域；与同源蛋白进行序列比对，制作系统进化树以了解其在系统进化中的位置。结果表明，该蛋白基因在基因组中横跨200 kb的序列区域，预测编码肌联蛋白的mRNA大约由74 kb组成，推测相对分子质量约为2 700 ku；该蛋白由Ig、Fn、kinase结构域，PEVK结构域和unique序列组成；在系统发育方面，该蛋白归属于原口动物集团。牡蛎肌联蛋白是一种新型的肌联蛋白样蛋白。

生物信息学；基因组；肌联蛋白；同源蛋白

肌联蛋白是相对分子质量约为300万ku的巨大弹性蛋白质［1］，由1个分子连接肌小节的Z线到M线［2-3］。肌联蛋白的弹性与肌小节的结构维持和被动张力有关［4］，该种弹性性质与存在于肌小节I带区域的免疫球蛋白（immunoglobulin，Ig）结构域、PEVK 区域、unique 序列有关［2，5-7］。 在无脊椎动物横纹肌中，从其一级结构和抗体交叉反应方面来看，存在很多类似肌联蛋白的肌联蛋白样蛋白（connectin-like protein），如线虫 TTN-1、小龙虾凸出蛋白、昆虫凸出蛋白等［8-12］。

在软体动物平滑肌中，当细肌丝和粗肌丝相互作用产生收缩后，存在一种叫做捕捉（catch）的结构，它能利用少量能量维持长时间的张力。……