环境DNA metabarcoding及其在生态学研究中的应用

陈　炼，吴　琳，刘　燕，徐海根,*

1 环境保护部南京环境科学研究所, 南京　210042 2 江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院, 南京　210013



环境DNA metabarcoding及其在生态学研究中的应用

陈炼1, 2，吴琳2，刘燕1，徐海根1,*

1 环境保护部南京环境科学研究所, 南京210042 2 江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院, 南京210013

环境DNA metabarcoding(eDNA metabarcoding)是指利用环境样本(如土壤、水、粪便等)中分离的DNA进行高通量的多个物种(或高级分类单元)鉴定的方法。近年来，该方法引起了学者的广泛关注，逐渐应用于生物多样性研究、水生生物监测、珍稀濒危物种和外来入侵物种检测等生态学领域。介绍环境DNA metabarcoding的含义和研究方法；重点介绍环境DNA metabarcoding在物种监测、生物多样性研究和食性分析等生态学领域中的应用；总结环境DNA metabarcoding应用于生态学研究领域面临的挑战并对该方法的发展进行展望。

环境DNA；metabarcoding；生物多样性；物种监测

在生态学研究中，要实现对物种有效的管理与保护首先要对物种分布有清晰而明确的认识，这需要建立准确、快速的物种监测机制。近年来，环境DNA metebarcoding被广泛地应用于生态学的研究中。环境DNA metabarcoding是在DNA条形码技术的基础上研究出来的新兴方法。该方法从环境样品中直接提取DNA，当结合第二代测序技术时可以实现对环境样品中所有存在物种的有效检测，在生物多样性研究、物种监测、动物食性分析和外来入侵物种检测等方面都有较好的应用前景。

1　环境DNA metabarcoding

1.1环境DNA

环境DNA(environmental DNA, eDNA)的概念早在20世纪80年代末就已经被提出，最初仅应用于微生物研究领域，它是指从环境样品(如土壤、沉积物、空气、水体等)中提取的DNA，不对任何目标生物进行分离[1]。……