李会萍 黎帮勇 胡尚连 曹 颖
(1.西南科技大学植物细胞工程实验室,绵阳 621010; 2.四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心, 绵阳 621010)
2个慈竹NAC转录因子的克隆与组织表达分析
李会萍 黎帮勇 胡尚连*曹 颖
(1.西南科技大学植物细胞工程实验室,绵阳 621010;2.四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心, 绵阳 621010)
以慈竹转录组数据为基础,结合毛竹基因组数据,采用同源克隆技术从慈竹中克隆到两个NAC基因BeNAC1(GenBank注册号:KU550706)和BeNAC2(GenBank注册号:KU821586),分别编码313和389个氨基酸残基。蛋白功能域预测和保守结构域多重对比分析表明,BeNAC1和BeNAC2基因均含有NAM保守域,其模拟的蛋白质三维结构与已知晶体结构的水稻模型蛋白高度相似。亚细胞定位预测分析显示,BeNAC1主要集中在细胞质中;BeNAC2则主要集中在细胞核中。表达分析表明,BeNAC1和BeNAC2具有相似的组织特异性表达,在茎中表达量均明显高于笋和叶片,且BeNAC1在除笋之外各组织中的表达量均显著高于BeNAC2。
慈竹;NAC转录因子;克隆;生物信息学分析;组织表达模式
慈竹(Bambusaemeiensis)是西南地区尤其四川省的主要竹种之一,其纤维具有一定的机械强度,故具备生产较高强度纸张的条件[1]。由于开花周期难以预测,且开花竹生长即衰败[2],使其传统遗传改良方法受到极大的限制。以往对慈竹在生长状况[3]、生理生化[4]、遗传多样性[5]、功能基因克隆[6]等方面的研究,为其品种改良提供了一定的基础,但有关NAC转录因子方面的研究鲜见报道。
NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,它的N端为高度保守的结构域,C端为高度变异的转录激活区[7~8]。……