利用SSR分子标记研究国内外黍稷地方品种和野生资源的遗传多样性

连 帅，陆 平，乔治军，张 琦，张 茜，刘敏轩，王瑞云

（1山西农业大学农学院，山西太谷 030801；2中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081；3山西农业科学院品种资源研究所，太原 030031）

利用SSR分子标记研究国内外黍稷地方品种和野生资源的遗传多样性

连 帅1,2，陆 平2，乔治军3，张 琦2，张 茜2，刘敏轩2，王瑞云1

（1山西农业大学农学院，山西太谷 030801；2中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081；3山西农业科学院品种资源研究所，太原 030031）

【目的】从分子水平研究国内外黍稷种质资源的遗传多样性差异，为黍稷种质资源的研究、保护和利用提供依据。【方法】用不同地理来源且性状差异显著的6份黍稷种质资源对来自高通量测序技术开发的黍稷基因组SSR引物进行筛选，从而获得条带清晰，稳定性好的63对SSR黍稷基因组引物，利用这63对SSR多态性引物对来自国内外的192份黍稷地方品种和野生种质进行遗传多样性分析。统计各试材在同一引物中的条带情况，并以此来分析试材的遗传多样性与所在群体间的亲缘关系。【结果】63对SSR引物共检测出161个等位变异位点，平均每个SSR位点2.56个；平均Shannon-Weaver指数（I）为0.6275，平均基因多样度（Nei）为0.3874，平均PIC值为0.4855。10个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异，各群体的有效等位变异变化范围较窄，最小的是南方群体，为1.2407±0.4315；最大的是内蒙古高原群体，为1.8846±0.4892。国内群体Shannon-Weaver指数为内蒙古高原＞东北地区＞黄土高原＞西北地区＞南方地区，而国外Shannon-Weaver指数排序依次为前苏联＞欧洲＞蒙古＞印度＞美国。从Nei’s基因杂合度分析，观察杂合度(Ho)最小的是印度群体，为0.2372±0.2962，最大的是内蒙古高原群体，为0.3966±0.3250。……