张彬 王长利
(天津医科大学肿瘤医院肺部肿瘤科 国家肿瘤临床医学研究中心 天津市肿瘤防治重点实验室,天津 300060)
端粒长度检测方法及其应用
张彬 王长利
(天津医科大学肿瘤医院肺部肿瘤科 国家肿瘤临床医学研究中心 天津市肿瘤防治重点实验室,天津 300060)
人类的衰老与肿瘤的发生是影响人寿命的重要因素,几十年来的研究表明端粒长度的变化在这两个进程中扮演了极其重要的角色,因此熟知分析端粒长度的方法就显得非常重要。目前,有多种端粒长度检测的方法,包括端粒末端限制性片段分析(terminal restriction fragment,TRF),定量PCR(qPCR),荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)和单链端粒长度分析(single telomere length analysis,STELA)等。但每种方法都有适用的范围,在研究和应用过程中需要熟知各种方法的原理、优势和局限,从而选择合适的检测方法,才能达到我们的研究目的,解决具体问题。因此将对目前常用的端粒长度检测方法进行综述。
端粒长度;端粒末端限制性片段分析;定量PCR;荧光原位杂交;单链端粒长度分析
端粒是真核染色体末端一段特殊的结构,由端粒重复序列和端粒结合蛋白组成。端粒能够防止染色体末端的降解、融合和重排,从而在维持染色体的完整性和稳定性上起重要作用[1-3]。人类二倍体细胞有46条染色体92个端粒,序列是由富含G的短双链重复序列TTAGGG串联组成,双链区长度一般在0.5-20 kb。其中富含G碱基的一条链在3'末端比其互补链多出100-200 bp核苷酸,形成一条突出的3'单链DNA。这条突出的端粒单链DNA被反折插入到端粒DNA的双链区,从而使染色体DNA终止于一种T型环(T-Loop)结构,将末端端粒DNA与细胞内环境隔绝,端粒作为染色体的保护性帽来防止DNA损伤信号对染色体末端的识别[4,5]。……