基于局部强化最小二乘回归子空间分割的基因表达数据聚类

2016-12-21 02:32:56简彩仁翁谦
三明学院学报 2016年6期
关键词:方法

简彩仁,翁谦

(1.厦门大学嘉庚学院,福建漳州363105;2.福州大学数学与计算机科学学院,福建福州350116)

基于局部强化最小二乘回归子空间分割的基因表达数据聚类

简彩仁1,翁谦2

(1.厦门大学嘉庚学院,福建漳州363105;2.福州大学数学与计算机科学学院,福建福州350116)

利用局部约束协同表示法改进最小二乘回归子空间分割方法,提出局部强化最小二乘子空间分割方法(LSLSR)。该方法通过近邻样本的协同作用强化重构系数使得LSLSR有更好的抗噪能力,结果表明该方法有较高的聚类准确率。

局部强化;最小二乘回归子空间分割;基因表达数据;聚类

聚类是模式识别研究的重要方向之一,其目标是将未知类别的数据根据某种特性分成不同的簇,使得每个簇都有相似的特点。聚类方法多种多样,传统的聚类方法:(1)基于划分的聚类方法,比如k-means算法[1];(2)基于层次的聚类算法,比如BIRCH算法[2];(3)基于密度的聚类算法,比如DBSCAN算法[3];(4)基于网格的方法,比如STING算法[4]。传统的算法不断改进和发展,出现了模糊聚类,谱聚类等。谱聚类[5]是一种基于图论的聚类算法,适合于各种形状的数据集的聚类,因而得到广泛应用。谱聚类的关键是构造图拉普拉斯矩阵。本文主要研究谱聚类。

子空间分割(subspace segmentation)是近年来模式识别研究的热点问题之一,已经广泛应用在图像分割、人脸识别和机器视觉等领域[6-8],并且在基因表达数据识别中也有广泛应用[9]。子空间分割方法的目标是将数据集分割成不同的簇。子空间分割的主要思想是,假设每一个数据集都是从混合子空间采样的,其目标是将数据集分割成几个簇,每一个簇对应于一个子空间[8]。……

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