利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP在家族性腺瘤性息肉病发病机制的研究*

杨 军，刘为青，李文亮，王志强，董 坚,3△

(1.昆明医科大学第一附属医院肿瘤科，昆明 650032;2.昆明医科大学第一附属医院肿瘤内科，昆明 650032;3.昆明医科大学第三附属医院肿瘤内科，昆明 650106)

利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP在家族性腺瘤性息肉病发病机制的研究*

杨 军1，刘为青2，李文亮1，王志强1，董 坚2,3△

(1.昆明医科大学第一附属医院肿瘤科，昆明 650032;2.昆明医科大学第一附属医院肿瘤内科，昆明 650032;3.昆明医科大学第三附属医院肿瘤内科，昆明 650106)

目的 利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP(sSNP)在家族性腺瘤性息肉病(FAP)中的发病机制。方法 选取云南省遗传性大肠癌组织标本库中的5个FAP患者的组织标本进行APC基因突变比对分析，将筛选得到的sSNP进行生物信息学预测，包括蛋白编码、剪接调节、转录调节、翻译后调节，并对RNA二级结构影响分析方面的预测。结果 筛选得到5个可能对APC蛋白产生影响的sSNP，生物信息学预测提示这些sSNP 在mRNA水平影响剪接增强子(ESE)从而引起APC外显子异常剪切，使APC蛋白截短而导致FAP。RNA二级结构分析发现这些sSNP对RNA稳定、与其他RNA或蛋白的相互作用等产生功能性影响。结论 利用生物信息学预测手段，APC基因的某些sSNP引起的突变效应可以解释部分APC阴性FAP的病因。

基因；腺瘤息肉病，结肠；遗传性疾病，先天性；家族性腺瘤样息肉病；APC基因；同义突变SNP；生物信息学工具

家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)是一类特殊类型的遗传性大肠癌，其临床表现为消化系统特别是下消化道黏膜遍布成百上千的腺瘤性息肉,这些息肉最终都将转变为结直肠癌。……