烟草青枯病病圃土壤细菌组成的高通量测序分析

曹 毅，陆 宁，陈兴江，孟建玉，商胜华

(贵州省烟草科学研究院，贵州 贵阳 550081)

烟草青枯病病圃土壤细菌组成的高通量测序分析

曹 毅，陆 宁，陈兴江，孟建玉，商胜华

(贵州省烟草科学研究院，贵州 贵阳 550081)

为了解烟草青枯病与土壤细菌群落结构的关系，采用454焦磷酸测序技术对烟草青枯病抗性鉴定圃中的土壤细菌组成进行了分析。结果表明，从病圃土壤中获得了1 963条高质量序列，归属于14个已知细菌门类、尚未培养出的细菌和分类地位未知的种类，其中变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、浮霉菌门、放线菌门、芽单胞菌门为病圃土壤中的优势菌群，分别占总菌群数的29.91%、17.10%、13.73%、11.46%、7.08%、6.40%。烟草青枯病病圃土壤中的拟杆菌门和放线菌门细菌在总菌群中丰度较低，可能与烟草青枯病发生存在关联。

烟草； 青枯病； 土壤； 细菌群落； 高通量测序

烟草青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstoniasolanacearum)引起的一种细菌性土传病害，具有广泛的寄主，可以侵染50多个科的200多种植物，其中烟草、马铃薯、番茄等茄科作物受害最为严重[1]。从1880年在美国北卡罗来纳州首次被发现至今已有130余年的历史，如今烟草青枯病几乎分布于世界上所有烤烟种植区，其中热带和亚热带烟区发病尤为严重，该病是威胁世界烟草生产的一大毁灭性病害[2]。目前，利用化学防治、合理轮作、抗病品种、植物抗性诱导、土壤改良修复及综合防控等措施防治作物青枯病均未能有效控制病害的发生[3-6]。发展对人畜安全、环境友好的生物防治备受重视。……