基于Linux的高性能计算集群MPI并行环境配置研究

金能智++者建武++李唐艳++孙一桐

摘 要：高性能计算集群是当前较为先进的计算体系，是融合了计算、存储、网络和软件的综合体系，高性能计算的快速发展已为其他科学技术的发展提供了越来越广的支撑，而MPI并行环境是高性能计算集群的要素。该文以MPICH3.2为例，从集群无密码访问、MPICH3.2编译安装、配置环境变量、并行环境测试等方面详细阐述了并行环境的配置过程。

关键词：Linux 高性能计算 集群 MPI 并行环境

中图分类号：TP393 文献标识码：A 文章编号：1674-098X（2017）01（c）-0116-02

理论推导和科学实验长期以来一直是人们研究和探索自然的两大方法，但随着高性能计算技术和应用的迅猛发展，计算模拟已成为科学研究中不可缺少的第三种方法[1]。高性能计算已在基础科学研究、工业设计、装备制造等各个领域广泛应用，解决了一些重大科学和工程问题，对支撑科技创新、推动经济发展起到了重要作用[2]。

高性能计算（High performance computing，HPC）作为计算科学的必备基础设施，已经成为国家之间的战略必争点和创新转型的利器，各国都投入巨资争夺世界制高点。中国的高性能计算系统研制水平和能力经过10多年的快速发展，已经跻身世界先进水平的行列。2010年11月，国际TOP500组织在网站上公布了最新全球超级计算机前500强排行榜，中国首台千万亿次超级计算机系统“天河一号”排名全球第一，是中国国产超级计算机首次夺得世界冠军[3]。2013年6月，“天河二号”以峰值速度、持续速度成为当时最快的超级计算机[4]。2016年6月20日，国际TOP500组织在法兰克福世界超算大会（ISC）上，“神威·太湖之光”超级计算机系统登顶榜单之首，成为世界上首台运算速度超过10亿亿次的超级计算机。……