马双双 王学勇 刘春生 肖瑶 赵保胜 张驰 李妍芃 王娟 田思敏 冯琼
·论著·
基于ITS条形码的维药克孜力乔古鲁克药材的分子鉴定研究
马双双 王学勇 刘春生 肖瑶 赵保胜 张驰 李妍芃 王娟 田思敏 冯琼
目的 对维药克孜力乔古鲁克药材(Paeoniaeradixhybridae,PRH)的品种进行精准鉴别,同时将其原植物块根芍药PaeoniahybridaPall.与窄叶芍药P.anomalaL.和新疆芍药P.sinjiangensisK.Y.Pan进行区分,为保证药材来源的准确性提供科学依据。 方法 提取块根芍药的DNA,基于内部转录间隔区的核糖体DNA序列(ITS)进行PCR引物扩增并测序,并从GenBank数据库下载块根芍药和其原变种窄叶芍药和近缘种新疆芍药的ITS序列,采用DNAMAN、Editseq、MeGA5等软件,计算块根芍药种间、种内的Kimura 2-parameter(K 2-P)遗传距离,寻找块根芍药的特异位点,并构建Neighbor-joining(N-J)系统聚类树。 结果 块根芍药G+C含量范围为55.82%~56.45%,与另外两个种G+C含量未重叠;所有样本ITS序列的K 2-P遗传距离范围为0~0.026,其中种间遗传距离分布为0.014~0.026,大于块根芍药种内遗传距离0.000~0.012;通过序列比对分析,发现块根芍药与另外2个种有6个特异位点;N-J系统聚类树也将19个样品聚为两个大支系,所有块根芍药聚为一支,有84%支持率,其中中国地区分布的块根芍药聚为一小支,俄罗斯地区分布的块根芍药亲缘关系较远。 结论 经过遗传距离、系统聚类、特异位点分析等系统研究发现ITS序列能区分块根芍药与其原变种窄叶芍药和近缘种新疆芍药,可以应用于维药PRH的精准鉴别,并且在变种与原变种的区分方面有很大潜力。
克孜力乔古鲁克; 块根芍药; 内转录间隔区; 遗传多样性;……