微生物功能基因组学的研究方法综述

朱江平

摘 要：功能基因组学在结构基因组所提供的高通量的信息资源以及丰富的生成产物基础上，通过在基因组水平或系统水平上全面分析基因的功能，针对多个基因或蛋白质组成系统的进行研究，来得到基因的表达、调控与功能以及生物的生长、发育的相关规律。本文介绍了功能基因组学的各种研究方法，并分析其发展状况。

关键词：功能基因组；高通量数据；生物信息学

中图分类号：Q933 文献标识码：A 文章编号：1671-2064（2017）10-0190-01

功能基因组学（后基因组学），是在结构基因组所提供的丰富的高通量信息资源以及大量各类生成产物的基础上发展起来的基因组学的子学科。其通过在功能基因组水平或功能系统水平上全面地分析基因的功能，发展和提出了多种实验手段和分析方法，使得生物学的研究对象由单一基因或蛋白质转为多个基因或蛋白质组成的系统，进而得到关于基因表达、调控、功能以及生物的生长、发育的相关规律。

1 差异显示反转录PCR技术

差异显示反转录PCR（DDRT—PCR）技术是由Liang和Pardee等提出的，以PCR和聚丙烯酞胺凝胶电泳为基础的功能基因组学的传统方法。该方法的基本原理是：以1对细胞（或组织） 的總RNA反转录而成的cDNA为模板，利用PCR的高效扩增，通过5端和3端引物的合理设计和组合，将细胞（或组织） 中表达的基因片段直接显示在DNA测序胶上，从而找出1对细胞（或组织）中表达有差异的cDNA片断。DDRT—PCR具有周期短，功能多，灵敏度高，所需RNA的量较少并且重复性较高等优点。……