马齿苋ISSR—PCR反应体系与反应条件的优化

2017-07-13 05:23:57王昭云那冬晨
安徽农业科学 2017年13期

王昭云 那冬晨

摘要 [目的]优化马齿苋ISSR-PCR反应体系与反应条件。[方法]以马齿苋为试验材料,采用改良的CTAB法提取总DNA,对ISSR-PCR引物进行筛选,同时进行ISSR-PCR反应体系和反应条件的优化,电泳检测ISSR-PCR产物。[结果]8个ISSR引物适合马齿苋的ISSR-PCR分析;最适反应体系为总体系25.0 μL,其中2×Taq Platinum PCR Master Mix 12.5 μL,10 μmol/L引物2.0 μL,40 mg/L DNA模板1.0 μL,ddH2O 9.5 μL;最适反应条件为94 ℃预变性360 s;

94 ℃变性60 s,54 ℃退火60 s,72 ℃延伸90 s,30次循环;72 ℃再延伸300 s。[结论]建立了马齿苋ISSR-PCR扩增的最佳反应体系和扩增程序,为进一步研究马齿苋提供基础资料。

关键词 马齿苋;ISSR-PCR;反应体系;反应条件

中图分类号 S647 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2017)13-0147-02

Optimization of ISSR-PCR Reaction System and Reaction Condition of Portulaca oleracea L.

WANG Zhao-yun1,NA Dong-chen1,2 *

(1.Modern College of Arts and Sciences,Shanxi Normal University, Linfen,Shanxi 041000;2.College of Life Sciences,Shanxi Normal University,Linfen,Shanxi 041000)

Abstract [Objective]To optimize ISSR-PCR reaction system and reaction condition of Portulaca oleracea L.[Method]Taking P.oleracea L.as the research object,using improved CTAB method to extract total DNA of P.oleracea L.,the ISSR-PCR primers were screened,at the same time ISSR-PCR reaction system and reaction condition were optimized to test ISSR-PCR products by electrophoresis.[Result]Eight primers were suitable for ISSR-PCRof P.oleracea L..The optimal reaction system was that total reaction system 25.0 μL,including 12.5 μL 2×Taq Platinum PCR Master Mix,2.0 μL 10 μmol/L primers,1.0 μL 40 mg/L DNA templates,9.5 μL ddH2O.The optimal reaction condition was that pre-degeneration at 94 ℃ for 360 s,going to 30 cycles:degeneration at 94 ℃ for 60 s,annealing at 54 ℃ for 60 s,extension at 72 ℃ for 90 s,then extension at 72 ℃ for 300 s after 30 cycles.[Conclusion]The optimizing ISSR-PCR reaction system and reaction condition of P.oleracea L.were established to provide basis for further study P.oleracea L..

Key words Portulaca oleracea L.;ISSR-PCR;Reaction system;Reaction condition

馬齿苋(Portulaca oleracea L.)为马齿苋科马齿苋属一年生草本植物,药食两用[1]。全株无毛,茎紫红色,圆柱形,平卧或斜倚,伏地铺散,叶互生,有时近对生,叶片扁平,肥厚,倒卵形,顶端圆钝或平截,有时微凹,基部楔形,全缘[2]。马齿苋适应性强,适宜在温暖、湿润、肥沃的壤土或沙壤土中生长,耐旱亦耐涝,生于田野路边及庭园废墟等向阳处,国内各地均有分布。

ISSR是在简单重复序列(SSR)基础上发展起来的新型分子标记,由加拿大蒙特利尔大学的Zietkiewicz等[3]提出。ISSR综合了其他分子标记高多态性、可重复性、低成本、易操作以及无需知道基因组序列等优点[4-5],现已被广泛应用于鉴定种质、分析遗传关系、构建遗传图谱等研究[6]。该研究以马齿苋为试验材料,对影响ISSR-PCR反应体系的各因素进行优化,建立马齿苋ISSR-PCR扩增的最佳反应体系和扩增程序,为进一步研究马齿苋提供基础资料。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 植物材料。

马齿苋,采于山西省临汾市汾河公园,该地处于半干旱、半湿润的气候区,属暖温带大陆型气候,冬寒夏热,四季分明,雨热同期。……

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